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B型肝炎は世界で最も一般的な感染症の1つであり、3億5,000万人が世界中の慢性B型肝炎ウイルスキャリアと推定されています。B型肝炎ウイルス（HBV）は、完全なヌクレオチド配列における8％以上のグループ間発散に基づいて、8つの遺伝子型（A-H）に分類されています。B型肝炎ウイルスのさまざまな遺伝子型は、疾患の臨床結果に影響を与える可能性があります。制限フラグメント長多型（RFLP）を使用したHBVジェノタイピング法は、遺伝子型を確実に識別できます。S遺伝子配列によるHBVジェノタイピングは、完全なゲノム配列を使用した遺伝子分析と一致しています。この研究の目的は、Elazigの領域で制限フラグメント長多型（RFLP）法を使用してHBVの遺伝子型を決定することでした。合計127人のHBV-DNA陽性患者（男性74人、女性53人）が研究に含まれていました。HBV S遺伝子の特定の部分を増幅するために、半ネストポリメラーゼ連鎖反応（PCR）を実行しました。最初のステップでは、685ベースペア（BP）領域はSense Primer HBMF1およびAnti-Sense Primer HBMR2によって増幅され、2番目のステップ485 bp領域では、内センスプライマーHBMF2および抗センスプライマーHBMR2を使用して増幅されました。次に、PCR産物は、制限酵素、ALWL、Earl、HPHL、NCIL、およびNLALVによって消化されました。RFLPアッセイは、遺伝子型Dがサンプルで唯一の検出されたタイプであることを示しました。結論として、遺伝子型Dは、私たちの地域のB型肝炎患者の間で主要なタイプです。RFLPは、HBV株をジェノタイピングするための簡単で便利な方法であると考えられています。
B型肝炎は世界で最も一般的な感染症の1つであり、3億5,000万人が世界中の慢性B型肝炎ウイルスキャリアと推定されています。B型肝炎ウイルス（HBV）は、完全なヌクレオチド配列における8％以上のグループ間発散に基づいて、8つの遺伝子型（A-H）に分類されています。B型肝炎ウイルスのさまざまな遺伝子型は、疾患の臨床結果に影響を与える可能性があります。制限フラグメント長多型（RFLP）を使用したHBVジェノタイピング法は、遺伝子型を確実に識別できます。S遺伝子配列によるHBVジェノタイピングは、完全なゲノム配列を使用した遺伝子分析と一致しています。この研究の目的は、Elazigの領域で制限フラグメント長多型（RFLP）法を使用してHBVの遺伝子型を決定することでした。合計127人のHBV-DNA陽性患者（男性74人、女性53人）が研究に含まれていました。HBV S遺伝子の特定の部分を増幅するために、半ネストポリメラーゼ連鎖反応（PCR）を実行しました。最初のステップでは、685ベースペア（BP）領域はSense Primer HBMF1およびAnti-Sense Primer HBMR2によって増幅され、2番目のステップ485 bp領域では、内センスプライマーHBMF2および抗センスプライマーHBMR2を使用して増幅されました。次に、PCR産物は、制限酵素、ALWL、Earl、HPHL、NCIL、およびNLALVによって消化されました。RFLPアッセイは、遺伝子型Dがサンプルで唯一の検出されたタイプであることを示しました。結論として、遺伝子型Dは、私たちの地域のB型肝炎患者の間で主要なタイプです。RFLPは、HBV株をジェノタイピングするための簡単で便利な方法であると考えられています。
Hepatitis B is one of the most common infectious diseases in the world, and 350 million people have been estimated to be chronic hepatitis B virus carriers world-wide. Hepatitis B virus (HBV) has been classified into 8 genotypes (A-H) based on an intergroup divergence of 8% or more in the complete nucleotide sequence. Different genotypes of the hepatitis B virus may influence the clinical outcome of the disease. HBV genotyping method using restriction fragment length polymorphism (RFLP) can reliably identify genotypes. HBV genotyping with S gene sequence is consistent with genetic analysis using the full genomic sequences. The aim of this study was to determine the genotypes of HBV by using restriction fragment length polymorphism (RFLP) method in the region of Elazig. A total of 127 HBV-DNA positive patients (74 male, 53 female) were included in the study. Semi-nested polymerase chain reaction (PCR) was performed to amplify the specific parts of HBV S gene. In the first step, 685 base paired (bp) region was amplified by sense primer HBMF1 and anti-sense primer HBMR2, while in the second step 485 bp region was amplified by using inner-sense primer HBMF2 and anti-sense primer HBMR2. PCR products were then digested by the restriction enzymes, Alwl, Earl, Hphl, Ncil and NlalV. The RFLP assay indicated that genotype D was the only detected type in our samples. In conclusion, genotype D is the predominant type among hepatitis B patients in our region. RFLP is considered to be an easy and useful method for genotyping HBV strains.
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