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背景：細胞株MDA-MB-435の起源の組織は、DNAマイクロアレイデータの分析がRoss et al。（2000、Nat Genet 24（3）：227-235）メラノーマ細胞株と類似しているため、メラノサイト起源である可能性があることを示唆しています。以前に、複数の研究所で維持されているMDA-MB-435細胞が、Ross et al。MDA-MB-435細胞は乳がんの代表的なモデルではないと結論付けました。しかし、MDA-MB-435細胞株の黒色腫様特性が誤分類の結果であるか、黒色腫様表現型への変化によるものであるかどうかを判断することはできませんでした。 方法：核型、比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）、およびマイクロサタライト多型分析を使用し、遺伝子発現および単一ヌクレオチド多型（SNP）データのバイオインフォマティクス分析と組み合わせて、MDA-MB-435細胞株が由来する仮説をテストしました。黒色腫細胞株M14。 結果：MDA-MB-435およびM14細胞株は、遺伝子発現パターンと同様に細胞遺伝学的特性に関して本質的に同一であり、見られる小さな違いは表現型および遺伝子型のクローンドリフトによって説明できることを示しています。 結論：MDA-MB-435細胞の現在利用可能なすべての在庫は、M14黒色腫細胞株に由来し、乳がんのモデルとは見なされなくなりました。これらの細胞は依然として癌転移の研究にとって貴重なシステムであり、1982年以来これらの細胞を使用した広範な文献は、メラノーマ研究コミュニティにとって貴重な新しいリソースを表しています。
背景：細胞株MDA-MB-435の起源の組織は、DNAマイクロアレイデータの分析がRoss et al。（2000、Nat Genet 24（3）：227-235）メラノーマ細胞株と類似しているため、メラノサイト起源である可能性があることを示唆しています。以前に、複数の研究所で維持されているMDA-MB-435細胞が、Ross et al。MDA-MB-435細胞は乳がんの代表的なモデルではないと結論付けました。しかし、MDA-MB-435細胞株の黒色腫様特性が誤分類の結果であるか、黒色腫様表現型への変化によるものであるかどうかを判断することはできませんでした。 方法：核型、比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）、およびマイクロサタライト多型分析を使用し、遺伝子発現および単一ヌクレオチド多型（SNP）データのバイオインフォマティクス分析と組み合わせて、MDA-MB-435細胞株が由来する仮説をテストしました。黒色腫細胞株M14。 結果：MDA-MB-435およびM14細胞株は、遺伝子発現パターンと同様に細胞遺伝学的特性に関して本質的に同一であり、見られる小さな違いは表現型および遺伝子型のクローンドリフトによって説明できることを示しています。 結論：MDA-MB-435細胞の現在利用可能なすべての在庫は、M14黒色腫細胞株に由来し、乳がんのモデルとは見なされなくなりました。これらの細胞は依然として癌転移の研究にとって貴重なシステムであり、1982年以来これらの細胞を使用した広範な文献は、メラノーマ研究コミュニティにとって貴重な新しいリソースを表しています。
BACKGROUND: The tissue of origin of the cell line MDA-MB-435 has been a matter of debate since analysis of DNA microarray data led Ross et al. (2000, Nat Genet 24(3):227-235) to suggest they might be of melanocyte origin due to their similarity to melanoma cell lines. We have previously shown that MDA-MB-435 cells maintained in multiple laboratories are of common origin to those used by Ross et al. and concluded that MDA-MB-435 cells are not a representative model for breast cancer. We could not determine, however, whether the melanoma-like properties of the MDA-MB-435 cell line are the result of misclassification or due to transdifferention to a melanoma-like phenotype. METHODS: We used karyotype, comparative genomic hybridization (CGH), and microsatalite polymorphism analyses, combined with bioinformatics analysis of gene expression and single nucleotide polymorphism (SNP) data, to test the hypothesis that the MDA-MB-435 cell line is derived from the melanoma cell line M14. RESULTS: We show that the MDA-MB-435 and M14 cell lines are essentially identical with respect to cytogenetic characteristics as well as gene expression patterns and that the minor differences found can be explained by phenotypic and genotypic clonal drift. CONCLUSIONS: All currently available stocks of MDA-MB-435 cells are derived from the M14 melanoma cell line and can no longer be considered a model of breast cancer. These cells are still a valuable system for the study of cancer metastasis and the extensive literature using these cells since 1982 represent a valuable new resource for the melanoma research community.
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