CellProfiler：細胞表現型を識別および定量化するための画像分析ソフトウェア

生物学者は、自動化を使用して1日あたり数千のサンプルを準備して画像化できるようになり、化学スクリーンや機能的ゲノミクスを可能にします（たとえば、RNA干渉を使用）。ここでは、柔軟なハイスループットセル画像分析であるCellProfiler用に設計された最初の無料のオープンソースシステムについて説明します。Cellprofilerは、標準アッセイ（細胞数、サイズ、あたりのタンパク質レベルなど）や複雑な形態学的アッセイ（たとえば、細胞/Orgenelle形状またはDNAまたはタンパク質染色の細胞内パターンなど）など、さまざまな生物学的質問に定量的に対処できます。

Biologists can now prepare and image thousands of samples per day using automation, enabling chemical screens and functional genomics (for example, using RNA interference). Here we describe the first free, open-source system designed for flexible, high-throughput cell image analysis, CellProfiler. CellProfiler can address a variety of biological questions quantitatively, including standard assays (for example, cell count, size, per-cell protein levels) and complex morphological assays (for example, cell/organelle shape or subcellular patterns of DNA or protein staining).