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Nature methods2006Nov01Vol.3issue(11)

遺伝子発現を強化するスーパーコアプロモーターの合理的な設計

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
概要
Abstract

転写は、遺伝子の発現における重要な成分です。ここでは、後生動物のRNAポリメラーゼIIによる大量の転写を指示するスーパーコアプロモーター1(SCP1)と呼ばれる強力なコアプロモーターの設計と分析について説明します。SCP1には、単一のプロモーターのTATAボックス、イニシエーター(INR)、モチーフ10エレメント(MTE)、および下流のプロモーター要素(DPE)の4つのコアプロモーターモチーフが含まれており、サイトメガロウイルス(CMV)IE1およびアデノウイルスメジャーレイトレイトよりも明らかに強いです。(ADML)in vitroおよびin vivoの両方でコアプロモーター。完全なSCP1アクティビティには、4つのコアプロモーターモチーフのそれぞれが必要です。SCP1はTFIIDによって効率的に結合され、生産的な転写複合体を形成する傾向が高い。複数のコアプロモーターモチーフを備えたSCP1および関連するスーパーコアプロモーター(SCPS)は、DNAへのTFIID結合の生物物理学的分析、転写プロセスの生化学的調査、および細胞における遺伝子発現の増強に役立ちます。

転写は、遺伝子の発現における重要な成分です。ここでは、後生動物のRNAポリメラーゼIIによる大量の転写を指示するスーパーコアプロモーター1(SCP1)と呼ばれる強力なコアプロモーターの設計と分析について説明します。SCP1には、単一のプロモーターのTATAボックス、イニシエーター(INR)、モチーフ10エレメント(MTE)、および下流のプロモーター要素(DPE)の4つのコアプロモーターモチーフが含まれており、サイトメガロウイルス(CMV)IE1およびアデノウイルスメジャーレイトレイトよりも明らかに強いです。(ADML)in vitroおよびin vivoの両方でコアプロモーター。完全なSCP1アクティビティには、4つのコアプロモーターモチーフのそれぞれが必要です。SCP1はTFIIDによって効率的に結合され、生産的な転写複合体を形成する傾向が高い。複数のコアプロモーターモチーフを備えたSCP1および関連するスーパーコアプロモーター(SCPS)は、DNAへのTFIID結合の生物物理学的分析、転写プロセスの生化学的調査、および細胞における遺伝子発現の増強に役立ちます。

Transcription is a critical component in the expression of genes. Here we describe the design and analysis of a potent core promoter, termed super core promoter 1 (SCP1), which directs high amounts of transcription by RNA polymerase II in metazoans. SCP1 contains four core promoter motifs-the TATA box, initiator (Inr), motif ten element (MTE) and downstream promoter element (DPE)-in a single promoter, and is distinctly stronger than the cytomegalovirus (CMV) IE1 and adenovirus major late (AdML) core promoters both in vitro and in vivo. Each of the four core promoter motifs is needed for full SCP1 activity. SCP1 is bound efficiently by TFIID and exhibits a high propensity to form productive transcription complexes. SCP1 and related super core promoters (SCPs) with multiple core promoter motifs will be useful for the biophysical analysis of TFIID binding to DNA, the biochemical investigation of the transcription process and the enhancement of gene expression in cells.

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