新規の生産性ウリジンの合成と特性

ウラシルのC-5位置で接続された生産性発色団を含む、新しい塩基分割蛍光（BDF）ヌクレオシド（PDN）Uを開発しました。（PDN）uのストークスシフト（Deltanu）は、フルオロフォアの周りの局所誘電特性に大きく依存していました。450 nmでの励起では、A（PDN）U/A塩基対を含む二重鎖の蛍光スペクトルが520 nmで強い放射を示しました。対照的に、「不一致」（PDN）U/N塩基対（n = c、g、またはt）を含む二重鎖の蛍光強度はかなり低かった。さらに、相補的なベースの性質による蛍光強度の劇的な変化は、SNPタイピングに役立ちます。

We have developed a novel base-discriminating fluorescent (BDF) nucleoside, (PDN)U, which contains a PRODAN chromophore connected at the C-5 position of uracil. The Stokes shift (Deltanu) of (PDN)U was highly dependent on the local dielectric property around the fluorophore. On the excitation at 450 nm, the fluorescence spectrum of the duplex containing a (PDN)U/A base pair showed a strong emission at 520 nm. In contrast, the fluorescence intensities of duplexes containing "mismatched" (PDN)U/N base pairs (N = C, G, or T) were considerably lower. Furthermore, the drastic change of fluorescence intensity by the nature of the complementary base is useful for SNP typing.