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ハウスキーピング遺伝子は、遺伝子発現分析の内部標準としてよく使用されます。4つの定常状態の転写レベルが通常使用されているハウスキーピング遺伝子、すなわちベータ - アクチン、グリセルアルデヒドデヒドロゲナーゼ、シクロフィリン、および酸性リボソームホスポロタンパク質P0（36B4）の定常状態の転写レベルが、さまざまなラット組織で評価されたように見えると、36B4遺伝子は評価されたように見えます。異なる組織間の遺伝子の発現レベルを比較するための標準として最も適しています。次に、異なる動物種間のこの遺伝子の発現レベルの可能な定量的比較のために、ラット、マウス、およびヒトの36B4のcDNAのヌクレオチド配列を比較しました。その結果、97.5％以上のアイデンティティを示す高度に保存された領域が、そのオープンリーディングフレームの5 '部分で観察されました。ラット、マウス、およびヒト36B4をコードする合成mRNAのサンプルがプローブとしてラット36B4をコードするcDNA全体でハイブリダイズした場合、マウスおよびヒト36B4のmRNAのハイブリダイゼーションシグナルは、ラット36B4をコードするmRNAのハイブリダイゼーションシグナルよりもはるかに弱かった。ただし、高度に保存された領域に対応するオリゴヌクレオチドプローブでハイブリダイズされた場合、同様の信号強度を示しました。したがって、36B4をコードするcDNAのこれらの高度に保存された領域は、遺伝子発現分析での使用の効果的な基準であると結論付けられました。
ハウスキーピング遺伝子は、遺伝子発現分析の内部標準としてよく使用されます。4つの定常状態の転写レベルが通常使用されているハウスキーピング遺伝子、すなわちベータ - アクチン、グリセルアルデヒドデヒドロゲナーゼ、シクロフィリン、および酸性リボソームホスポロタンパク質P0（36B4）の定常状態の転写レベルが、さまざまなラット組織で評価されたように見えると、36B4遺伝子は評価されたように見えます。異なる組織間の遺伝子の発現レベルを比較するための標準として最も適しています。次に、異なる動物種間のこの遺伝子の発現レベルの可能な定量的比較のために、ラット、マウス、およびヒトの36B4のcDNAのヌクレオチド配列を比較しました。その結果、97.5％以上のアイデンティティを示す高度に保存された領域が、そのオープンリーディングフレームの5 '部分で観察されました。ラット、マウス、およびヒト36B4をコードする合成mRNAのサンプルがプローブとしてラット36B4をコードするcDNA全体でハイブリダイズした場合、マウスおよびヒト36B4のmRNAのハイブリダイゼーションシグナルは、ラット36B4をコードするmRNAのハイブリダイゼーションシグナルよりもはるかに弱かった。ただし、高度に保存された領域に対応するオリゴヌクレオチドプローブでハイブリダイズされた場合、同様の信号強度を示しました。したがって、36B4をコードするcDNAのこれらの高度に保存された領域は、遺伝子発現分析での使用の効果的な基準であると結論付けられました。
Housekeeping genes are often used as internal standards for gene expression analysis. When steady-state transcript levels of 4 typically used housekeeping genes, i.e., beta-actin, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, cyclophilin, and acidic ribosomal phosphoprotein P0 (36B4), were evaluated in various rat tissues, the 36B4 gene seemed to be the most suitable as a standard to compare the expression levels of genes among different tissues. Next, for possible quantitative comparison of the expression level of this gene among different animal species, we compared the nucleotide sequence of the cDNA of 36B4 among rats, mice, and humans. As a result, highly conserved regions showing more than 97.5% identities were observed in the 5' portion of its open reading frame. When samples of synthesized mRNA encoding rat, mouse, and human 36B4 were hybridized with the entire cDNA encoding rat 36B4 as a probe, hybridization signals of mRNAs of mouse and human 36B4 were much weaker than those of mRNA encoding rat 36B4. However, when they were hybridized with an oligonucleotide probe corresponding to the highly conserved regions, they showed similar signal intensities. Thus, these highly conserved regions of the cDNA encoding 36B4 were concluded to be an effective standard for use in gene expression analysis.
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