関連するTN916様トランスポゾンの相互作用：TN916およびTN5386インテグラゼによって促進された切除イベントの分析

最近の研究では、「ジョイント」領域からの配列が共役トランスポゾンTN916と関連するモバイルエレメントTN5386の相互作用に起因することを示唆する腸球菌D344Rからの大きなゲノム領域の切除について説明しました。本研究では、TN916とTN5386からのインテグラゼとインテグラスとエクサゼゼの組み合わせの能力を調べて、TN916、TN5386、およびVANBモバイル要素TN5382の末端からなるコンストラクトの切除を促進しました。TN916またはTN5386のいずれかのいずれかからの積分は、コンストラクトで使用されている異なる末端が原産地のトランスポゾンで不調和だった場合でも、3つの異なるトランスポゾンからのコンストラクトの循環を促進しました。すべてのジョイントで見つかったTN916およびTN5382の末端は、以前に特定されたTN916およびTN5382末端と一致していました。循環化の原因となったインテグラゼに関係なく、関節を形成するために使用されるTN5386のインテグレーゼ末端で実質的な変動が見られました。TN916またはTN5382の末端で観察された関節とは対照的に、TN5386コンストラクトから形成された関節で変動性が観察されました。Excisaseの共発現は、観察された関節領域である程度のばらつきをもたらしました。これらのデータは、いくつかのTN916様要素からのインテグラゼが、異種トランスポゾンに由来する終末による循環を促進することができ、そのような要素が隣接する大きなゲノム領域の切除を促進できることを確認しています。また、これらの発見は、TN916様インテグラゼのC端子のシーケンス特異性に関する興味深い質問を提起し、端に結合し、鎖交換を促進します。

In recent work, we described the excision of a large genomic region from Enterococcus faecium D344R in which the sequence from "joint" regions suggested that excision resulted from the interaction of conjugative transposon Tn916 and the related mobile element Tn5386. In the present study, we examined the ability of integrases and integrase-excisase combinations from Tn916 and Tn5386 to promote the excision of constructs consisting of the termini of Tn916, Tn5386, and the VanB mobile element Tn5382. Integrases alone from either Tn916 or Tn5386 promoted the circularization of constructs from the three different transposons, even when the different termini used in the constructs were discordant in their transposon of origin. The termini of Tn916 and Tn5382 found in all joints were consistent with previously identified Tn916 and Tn5382 termini. Substantial variation was seen in the integrase terminus of Tn5386 used to form joints, regardless of the integrase that was responsible for circularization. Variability was observed in joints formed from Tn5386 constructs, in contrast to joints observed with the termini of Tn916 or Tn5382. The coexpression of excisase yielded some variability in the joint regions observed. These data confirm that integrases from some Tn916-like elements can promote circularization with termini derived from heterologous transposons and, as such, could promote excision of large genomic regions flanked by such elements. These findings also raise interesting questions about the sequence specificities of the C terminals of Tn916-like integrases, which bind to the ends and facilitate strand exchange.