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微量アミン関連受容体(TAAR)は、脊椎動物のGタンパク質共役受容体の特定のファミリーを形成します。TAARは当初、神経伝達物質受容体と見なされていましたが、最近の研究では、マウスTAARが嗅上皮の化学感覚受容体として機能することが示されました。脊椎動物におけるTAAR遺伝子ファミリーの進化的ダイナミクスを明確にするために、TAAR遺伝子と偽遺伝子のほぼ完全なレパートリー(ゼブラフィッシュ、フーグ、スティックバック、メダカ)のゲノムアセンブリから、西部のクローズドフロッグ、3つの鶏、3つの鶏肉のゲノムアセンブリから特定されました。哺乳類(人間、マウス、オポッサム)、および海のヤツメウナギ。データベース検索により、魚には多くの推定的に機能的なTAAR遺伝子(13-109遺伝子)があることが明らかになりましたが、比較的少数のTAAR遺伝子(3-22遺伝子)がテトラポッドで同定されました。これらの遺伝子の系統解析により、TAAR遺伝子ファミリーは、光線が発射された魚や四脚の発散の前に分岐する5つのサブファミリーに細分化されたことが示されました。テトラポッドでは、実質的にすべてのTAAR遺伝子が遺伝子クラスターとしてゲノムの1つの特定の領域に配置されていました。しかし、魚では、TAAR遺伝子が2つ以上のゲノム位置に散在していました。これはおそらく、光線漁の共通の祖先で発生した全ゲノムの重複を反映している可能性があります。ゼブラフィッシュとスティックバックのTAAR遺伝子の発現分析により、これらの魚の多くのTAARが嗅覚器官で発現していることが明らかになり、魚の化学感覚受容体としてのTAARの比較的高い重要性が示唆されました。脊椎動物TAAR遺伝子ファミリーの進化の歴史の可能性は、系統発生的および比較ゲノム分析から推測されました。
微量アミン関連受容体(TAAR)は、脊椎動物のGタンパク質共役受容体の特定のファミリーを形成します。TAARは当初、神経伝達物質受容体と見なされていましたが、最近の研究では、マウスTAARが嗅上皮の化学感覚受容体として機能することが示されました。脊椎動物におけるTAAR遺伝子ファミリーの進化的ダイナミクスを明確にするために、TAAR遺伝子と偽遺伝子のほぼ完全なレパートリー(ゼブラフィッシュ、フーグ、スティックバック、メダカ)のゲノムアセンブリから、西部のクローズドフロッグ、3つの鶏、3つの鶏肉のゲノムアセンブリから特定されました。哺乳類(人間、マウス、オポッサム)、および海のヤツメウナギ。データベース検索により、魚には多くの推定的に機能的なTAAR遺伝子(13-109遺伝子)があることが明らかになりましたが、比較的少数のTAAR遺伝子(3-22遺伝子)がテトラポッドで同定されました。これらの遺伝子の系統解析により、TAAR遺伝子ファミリーは、光線が発射された魚や四脚の発散の前に分岐する5つのサブファミリーに細分化されたことが示されました。テトラポッドでは、実質的にすべてのTAAR遺伝子が遺伝子クラスターとしてゲノムの1つの特定の領域に配置されていました。しかし、魚では、TAAR遺伝子が2つ以上のゲノム位置に散在していました。これはおそらく、光線漁の共通の祖先で発生した全ゲノムの重複を反映している可能性があります。ゼブラフィッシュとスティックバックのTAAR遺伝子の発現分析により、これらの魚の多くのTAARが嗅覚器官で発現していることが明らかになり、魚の化学感覚受容体としてのTAARの比較的高い重要性が示唆されました。脊椎動物TAAR遺伝子ファミリーの進化の歴史の可能性は、系統発生的および比較ゲノム分析から推測されました。
The trace amine-associated receptors (TAARs) form a specific family of G protein-coupled receptors in vertebrates. TAARs were initially considered neurotransmitter receptors, but recent study showed that mouse TAARs function as chemosensory receptors in the olfactory epithelium. To clarify the evolutionary dynamics of the TAAR gene family in vertebrates, near-complete repertoires of TAAR genes and pseudogenes were identified from the genomic assemblies of 4 teleost fishes (zebrafish, fugu, stickleback, and medaka), western clawed frogs, chickens, 3 mammals (humans, mice, and opossum), and sea lampreys. Database searches revealed that fishes had many putatively functional TAAR genes (13-109 genes), whereas relatively small numbers of TAAR genes (3-22 genes) were identified in tetrapods. Phylogenetic analysis of these genes indicated that the TAAR gene family was subdivided into 5 subfamilies that diverged before the divergence of ray-finned fishes and tetrapods. In tetrapods, virtually all TAAR genes were located in 1 specific region of their genomes as a gene cluster; however, in fishes, TAAR genes were scattered throughout more than 2 genomic locations. This possibly reflects a whole-genome duplication that occurred in the common ancestor of ray-finned fishes. Expression analysis of zebrafish and stickleback TAAR genes revealed that many TAARs in these fishes were expressed in the olfactory organ, suggesting the relatively high importance of TAARs as chemosensory receptors in fishes. A possible evolutionary history of the vertebrate TAAR gene family was inferred from the phylogenetic and comparative genomic analyses.
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