SMEDGD：Schmidtea Mediterranea Genomeデータベース

計画的なシュミッテア地中海は、再生、組織の恒常性、幹細胞生物学の研究のためのモデル生物として急速に出現しています。そのゲノムの最近のシーケンス、アセンブリ、アノテーションは、この生物の生物医学的重要性をさらに高めることが期待されています。ゲノム配列に関連する広範なデータを生物医学および計画的コミュニティにアクセスできるようにするために、Schmidtea Mediterranea Genome Database（SMEDGD）を作成しました。SMEDGDは、予測および注釈付きの遺伝子、EST、タンパク質ホモロジー、遺伝子発現パターン、RNAi表現型を含む、単一のWebアクセス可能なポータルにプラナリアンゲノムに関連するすべての利用可能なデータを統合します。さらに、SMEDGDは、Generic Model Orgonism Database（GMOD）プロジェクトから提供されるツールを使用して設計されているため、他のモデル生物データベースと互換性のあるデータ構造を作成しました。プラナリアンのユニークな系統発生的位置のため、Smedgd（http://smedgd.neuro.utah.edu）は、計画的研究コミュニティだけでなく、発達的および進化生物学、比較ゲノミクス、STEM細胞細胞に従事する人々にとっても有用であることが証明されます。研究と再生。

The planarian Schmidtea mediterranea is rapidly emerging as a model organism for the study of regeneration, tissue homeostasis and stem cell biology. The recent sequencing, assembly and annotation of its genome are expected to further buoy the biomedical importance of this organism. In order to make the extensive data associated with the genome sequence accessible to the biomedical and planarian communities, we have created the Schmidtea mediterranea Genome Database (SmedGD). SmedGD integrates in a single web-accessible portal all available data associated with the planarian genome, including predicted and annotated genes, ESTs, protein homologies, gene expression patterns and RNAi phenotypes. Moreover, SmedGD was designed using tools provided by the Generic Model Organism Database (GMOD) project, thus making its data structure compatible with other model organism databases. Because of the unique phylogenetic position of planarians, SmedGD (http://smedgd.neuro.utah.edu) will prove useful not only to the planarian research community, but also to those engaged in developmental and evolutionary biology, comparative genomics, stem cell research and regeneration.