NeuriteTracer：神経突起の伸長の自動定量化のための新しいImageJプラグイン

神経成長を測定するためのin vitroアッセイは、神経発達と再生を研究する多くの神経生物学者が使用する基本的なツールです。これらのアッセイの定量化には、神経突起培養における神経突起の長さと神経細胞数の正確な測定が必要です。一般に、これらの測定は、労働集約的なマニュアルまたは画像の半手動トレースを通じて取得されます。これらの測定値を自動化するために、自由に利用可能な画像処理プログラムImageJのためのニューライトトレースプラグインであるNeuritetracerを作成しました。プラグインは、解離した培養ニューロンの神経突起と核の蛍光顕微鏡画像を分析します。ユーザー定義のしきい値が与えられた場合、プラグインはニューロンの核をカウントし、神経突起の長さをトレースと測定します。神経突起は、小脳、DRG、および海馬ニューロンからの神経突起の成長を正確に測定することがわかります。NeuriteTracerによって得られた値は、Neuronjを使用したセミマニュアルトレースおよび洗練された分析パッケージを使用することによって得られた値と強く相関しています。Rhoキナーゼ阻害剤Y-27632の能力を促進する神経突起の伸長促進能力を検出する能力を実証することにより、神経炎因子の有用性を明らかにします。当社のプラグインは、完全に自動化され、自由にアクセス可能なイメージングプログラム内で使用できるため、既存のトレースツールに代わる魅力的な代替品です。

In vitro assays to measure neuronal growth are a fundamental tool used by many neurobiologists studying neuronal development and regeneration. The quantification of these assays requires accurate measurements of neurite length and neuronal cell numbers in neuronal cultures. Generally, these measurements are obtained through labor-intensive manual or semi-manual tracing of images. To automate these measurements, we have written NeuriteTracer, a neurite tracing plugin for the freely available image-processing program ImageJ. The plugin analyzes fluorescence microscopy images of neurites and nuclei of dissociated cultured neurons. Given user-defined thresholds, the plugin counts neuronal nuclei, and traces and measures neurite length. We find that NeuriteTracer accurately measures neurite outgrowth from cerebellar, DRG and hippocampal neurons. Values obtained by NeuriteTracer correlate strongly with those obtained by semi-manual tracing with NeuronJ and by using a sophisticated analysis package, MetaXpress. We reveal the utility of NeuriteTracer by demonstrating its ability to detect the neurite outgrowth promoting capacity of the rho kinase inhibitor Y-27632. Our plugin is an attractive alternative to existing tracing tools because it is fully automated and ready for use within a freely accessible imaging program.