ヒト胚性幹細胞に由来する決定的な内胚葉の転写プロファイリング

三層胚の内生殖層である決定的な内胚葉（de）は、胃腸管、その誘導体、甲状腺、胸腺、膵臓、肺、肝臓を形成します。アフリカツメガエル、ゼブラフィッシュ、マウスのDE形成に関する研究は、脊椎動物の間の保存された分子メカニズムを示唆しています。ただし、人間におけるこの活動に関する関連分析は、広範囲に実行されていません。多能性、増殖、生存、および分化状態を決定するシグナルにヒト胚性幹細胞（HESC）がどのように反応するかを監視するための技術の成熟により、ヒトで同様の研究を実施できるようになりました。この論文では、DEへのHESC分化のプロセス中に差次的に発現する遺伝子を特定するために、最近の2つの実験から得られた遺伝子発現プロファイルの分析を提示します。計算予測と比較ゲノム分析を使用して、関連する転写調節とシグナル伝達経路を理解するために、これらの遺伝子に関する体系的な研究を実施しました。私たちの予備的な結果は、HESC-DE形成の同様の転写プロファイルを他の脊椎動物の転写プロファイルと引き出します。

Definitive endoderm (DE), the inner germ layer of the trilaminar embryo, forms gastrointestinal tract, its derivatives, thyroid, thymus, pancreas, lungs and liver. Studies on DE formation in Xenopus, zebrafish and mouse suggest a conserved molecular mechanism among vertebrates. However, relevant analysis on this activity in human has not been extensively carried out. With the maturity of the techniques for monitoring how human embryonic stem cells (hESCs) react to signals that determine their pluripotency, proliferation, survival, and differentiation status, we are now able to conduct a similar research in human. In this paper, we present an analysis of gene expression profiles obtained from two recent experiments to identify genes expressed differentially during the process of hESCs differentiation to DE. We have carried out a systematic study on these genes to understand the related transcriptional regulations and signaling pathways using computational predictions and comparative genome analyses. Our preliminary results draw a similar transcriptional profile of hESC-DE formation to that of other vertebrates.