熱ストレスへの曝露時に熱ショックタンパク質70のダイナミクスを示す真核生物熱ショック反応のためのデジタルアナログハイブリッド制御モデル

このペーパーでは、完全な遺伝子調節ネットワークの研究のためのデジタルアナログハイブリッドモデルアプローチを紹介しています。真核生物の熱ショック応答（HSR）ネットワーク。HSRは、細胞へのさまざまなストレスのために発生する重要で広く研究されている細胞現象であり、タンパク質の完全性を維持することにより細胞の恒常性を回復する熱ショックタンパク質（HSP）の産生をもたらす熱ショック遺伝子の誘導によって特徴付けられます。HSRに関与する生物学的分子の機能を模倣し、それらのダイナミクスと動作をモデル化するシンプルなデジタルおよびアナログコンポーネントを組み込んだモデルを提案しています。HSP70の生産の回路のシミュレーション結果は、公開された実験結果と一致していることがわかっています。HSRの定性的挙動は、真実の表を通して表されます。この新しいアプローチを通じて、著者は、HSRシステムの部分とこのシステム全体の相互作用についてのレベルの理解を開発しようとしました。

We are introducing in this paper a digital-analog hybrid model approach for the study of a complete gene regulatory network; the heat shock response (HSR) network of eukaryotes. HSR is a crucial and widely studied cellular phenomenon occurring due to various stresses on the cell, and is characterised by the induction of heat shock genes resulting in the production of heat shock proteins (HSPs) which restores cellular homeostasis by maintaining protein integrity. We are proposing a model which incorporates simple digital and analog components which mimic the functioning of biological molecules involved in HSR and model their dynamics and behaviour. The simulation result of the circuit for the production of HSP70 has been found to be consistent with published experimental results. The qualitative behaviour of the HSR is expressed through a truth table. Through this novel approach, the authors have tried to develop a level of understanding of the interactions of the parts of the HSR system and of this system as a whole.