人間の青い目の色は、OCA2発現を阻害するHERC2遺伝子内にある調節要素の完全に関連する創設者変異によって引き起こされる可能性があります

人間の目の色は、多因子遺伝を示す定量的特性です。いくつかの研究では、OCA2遺伝子座が人間の目の色の変化の主要な貢献者であることが示されています。デンマークの大家族の連鎖分析により、青い目の色の遺伝子座をHERC2遺伝子内の166 kbp領域に挟み込みました。アソシエーション分析により、この領域内の2つのSNPを特定しました。このSNPは、青と茶色の目の色であるRS12913832およびRS1129038に完全に関連しています。これらのうち、RS12913832は、HERC2のイントロン86の高度に保存されたシーケンスで、OCA2プロモーターから21.152 bp上流に位置しています。RS12913832の茶色の目の色の対立遺伝子は、多くの種全体で高度に保存されています。細胞培養におけるルシフェラーゼアッセイによって示されるように、この元素はOCA2プロモーターの活性を大幅に低下させ、電気泳動移動シフトアッセイは、2つの対立遺伝子が核抽出物の異なるサブセットを結合していることを示しています。HERC2遺伝子の3 '末端の半分をカバーする6つの多型SNPで表される1つのハプロタイプは、デンマークの155人の青い目をした個体と、それぞれトルコとヨルダンの5人と2人の青い目の個人で発見されました。したがって、私たちのデータは、人間の青い目の色の原因として調節要素を阻害するOCA2の共通の創設者変異を示唆しています。さらに、髪の色とD14S72の間のZ = 4.21のLODスコアが大家族で得られ、Rabggtaが髪の色の候補遺伝子であることを示しています。

The human eye color is a quantitative trait displaying multifactorial inheritance. Several studies have shown that the OCA2 locus is the major contributor to the human eye color variation. By linkage analysis of a large Danish family, we finemapped the blue eye color locus to a 166 Kbp region within the HERC2 gene. By association analyses, we identified two SNPs within this region that were perfectly associated with the blue and brown eye colors: rs12913832 and rs1129038. Of these, rs12913832 is located 21.152 bp upstream from the OCA2 promoter in a highly conserved sequence in intron 86 of HERC2. The brown eye color allele of rs12913832 is highly conserved throughout a number of species. As shown by a Luciferase assays in cell cultures, the element significantly reduces the activity of the OCA2 promoter and electrophoretic mobility shift assays demonstrate that the two alleles bind different subsets of nuclear extracts. One single haplotype, represented by six polymorphic SNPs covering half of the 3' end of the HERC2 gene, was found in 155 blue-eyed individuals from Denmark, and in 5 and 2 blue-eyed individuals from Turkey and Jordan, respectively. Hence, our data suggest a common founder mutation in an OCA2 inhibiting regulatory element as the cause of blue eye color in humans. In addition, an LOD score of Z = 4.21 between hair color and D14S72 was obtained in the large family, indicating that RABGGTA is a candidate gene for hair color.