アヒルオルソウイルスのSクラスゲノムセグメントの配列と系統解析

一般的な特性にもかかわらず、アヒルのオルソオオウイルス（DRV）は、他の鳥類のオルソオウイルス（ARV）と抗原的に異なります。DRV S12のSクラスゲノムセグメントを分析し、ARV S1133のS133と比較して他のオルソリオウイルスのSクラスゲノムセグメントと比較しました。フルレングスSクラスのSigmaa、Sigmab、Sigmans、およびSigmac遺伝子を決定し、他のARVと比較して、DRVの遺伝的発散と進化の程度を研究しました。DRV 89026のDRV S12 Sigmaa、Sigmab、Sigmans、およびSigmac遺伝子の整列は、90.0％、93.6％、88.0％、および93.1％のヌクレオチド同一性と、97.1％、94.3％、95.8％、および93.7％Aminoid Adentyを示しました。それぞれ。DRV S12 SIGMAA、SIGMAB、SIGMANS、およびSIGMAC遺伝子の他のARVとのアライメントにより、76.0-77.1％、52.5-55.1％、78.4-79.6％、および2.7-9.9％ヌクレオチド同一性、89.5-91.2％、61.4-62.0それぞれ％、91.6-92.7％および22.6-26.7％アミノ酸同一性。系統解析により、DRVは他のARVとはまったく異なることが実証され、鳥類のオルソリオウイルスの多様性の証拠が提供されました。

In spite of common properties duck orthoreoviruses (DRVs) are antigenically different from other avian orthoreoviruses (ARVs). We analyzed the S-class genome segments of the DRV S12 and compared them with S-class genome segments of other orthoreoviruses compared to those of ARV S1133. The full-length S-class sigmaA, sigmaB, sigmaNS, and sigmaC genes were determined and compared with other ARVs to study the degree of genetic divergence and evolution of DRVs. The alignment of the DRV S12 sigmaA, sigmaB, sigmaNS, and sigmaC genes with DRV 89026 showed 90.0%, 93.6%, 88.0%, and 93.1% nucleotide identity and 97.1%, 94.3%, 95.8%, and 93.7% amino acid identity, respectively. The alignment of the DRV S12 sigmaA, sigmaB, sigmaNS, and sigmaC genes with other ARVs revealed 76.0-77.1%, 52.5-55.1%, 78.4-79.6%, and 2.7-9.9% nucleotide identity and 89.5-91.2%, 61.4-62.0%, 91.6-92.7% and 22.6-26.7% amino acid identity, respectively. Phylogenetic analyses demonstrated that DRVs were quite different from other ARVs and provided the evidence for the diversity among avian orthoreoviruses.