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脂質の正確なプロファイリングは、分析された細胞、液体、または組織からの脂質種の定量的かつ偏りのない回収に依存しており、通常、クロロホルムによる2相抽出によって達成されます。メチル - テルト - ブチルエーテル(MTBE)抽出により、脂質回復が迅速できれいになり、自動ショットガンプロファイリングに適していることが実証されました。MTBEの密度が低いため、脂質含有有機相は相分離中に上層を形成し、収集を簡素化し、滴下損失を最小限に抑えます。抽出不可能なマトリックスは、抽出チューブの底部に密なペレットを形成し、遠心分離により簡単に除去できます。厳密なテストは、MTBEプロトコルが、「金標準」のフォルまたはブライおよびダイアーのレシピと比較して、ほとんどすべての主要な脂質クラスの種の同様またはより良い回復を提供することを実証しました。
脂質の正確なプロファイリングは、分析された細胞、液体、または組織からの脂質種の定量的かつ偏りのない回収に依存しており、通常、クロロホルムによる2相抽出によって達成されます。メチル - テルト - ブチルエーテル(MTBE)抽出により、脂質回復が迅速できれいになり、自動ショットガンプロファイリングに適していることが実証されました。MTBEの密度が低いため、脂質含有有機相は相分離中に上層を形成し、収集を簡素化し、滴下損失を最小限に抑えます。抽出不可能なマトリックスは、抽出チューブの底部に密なペレットを形成し、遠心分離により簡単に除去できます。厳密なテストは、MTBEプロトコルが、「金標準」のフォルまたはブライおよびダイアーのレシピと比較して、ほとんどすべての主要な脂質クラスの種の同様またはより良い回復を提供することを実証しました。
Accurate profiling of lipidomes relies upon the quantitative and unbiased recovery of lipid species from analyzed cells, fluids, or tissues and is usually achieved by two-phase extraction with chloroform. We demonstrated that methyl-tert-butyl ether (MTBE) extraction allows faster and cleaner lipid recovery and is well suited for automated shotgun profiling. Because of MTBE's low density, lipid-containing organic phase forms the upper layer during phase separation, which simplifies its collection and minimizes dripping losses. Nonextractable matrix forms a dense pellet at the bottom of the extraction tube and is easily removed by centrifugation. Rigorous testing demonstrated that the MTBE protocol delivers similar or better recoveries of species of most all major lipid classes compared with the "gold-standard" Folch or Bligh and Dyer recipes.
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