SNPパネル識別アッセイ（SPIA）：細胞株の同定のための遺伝的ベースのアッセイ

翻訳研究は、モデルシステムで観察を行い、診断ツールの開発や標的治療などの臨床用途にそれらの発見を実装する能力にかかっています。腫瘍細胞株は、一般的に発がんのモデル化に使用されます。同じ腫瘍細胞株を、世界中の複数の研究研究所で同時に研究することができ、理論的には直接同等の結果を生成します。このパラダイムの重要な仮定の1つは、研究者が同じ細胞を使用していることです。ただし、高スループットゲノム分析を使用した最近の研究は、この仮定の精度に疑問を投げかけています。私たちのグループや他の人々による観察は、科学文献で報告された実験には、使用された細胞株の不正確なアイデンティティのために、分析前のエラーが含まれている可能性があることを示唆しています。この問題に対処するために、34個の単一ヌクレオチド多型（SNP）をジェノタイピングすることにより、細胞株の同一性の正確な決定を可能にする簡単なアプローチを開発しました。ここでは、長期的な研究使用の過程で腫瘍細胞株とヒト腫瘍サンプルの同一性を確保するために、実験室環境での日常的な使用と互換性のあるSNPパネル識別アッセイ（SPIA）の経験的発達について説明します。

Translational research hinges on the ability to make observations in model systems and to implement those findings into clinical applications, such as the development of diagnostic tools or targeted therapeutics. Tumor cell lines are commonly used to model carcinogenesis. The same tumor cell line can be simultaneously studied in multiple research laboratories throughout the world, theoretically generating results that are directly comparable. One important assumption in this paradigm is that researchers are working with the same cells. However, recent work using high throughput genomic analyses questions the accuracy of this assumption. Observations by our group and others suggest that experiments reported in the scientific literature may contain pre-analytic errors due to inaccurate identities of the cell lines employed. To address this problem, we developed a simple approach that enables an accurate determination of cell line identity by genotyping 34 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Here, we describe the empirical development of a SNP panel identification assay (SPIA) compatible with routine use in the laboratory setting to ensure the identity of tumor cell lines and human tumor samples throughout the course of long term research use.