ヨーロッパの野生のイノシシの遺伝的変異を形作る要因としての古代対最近のプロセス：最後の氷河期の影響はまだ検出可能ですか？

ヨーロッパの野生のイノシシは重要なゲーム種であり、過去に地元の絶滅と転座を受け、現在、経営陣が緊急に必要とされている一部の分野で非常に心配なほど拡大しています。したがって、この種の遺伝的構造を形作る際の古代および最近の出来事の相対的な役割を理解することは、興味深い科学的問題であるだけでなく、将来の管理戦略に対処するための基礎でもあります。さらに、いくつかのブタの品種はヨーロッパの野生のイノシシから降りますが、家畜化領域の地理的位置と野生個体群への豚ゲノムの遺伝性の可能性は依然として開かれた問題です。ここでは、ヨーロッパの異なる野生のイノシシ集団の遺伝的変異を分析しました。10個の多型のマイクロサテライトを252個のイノシシに入力し、mtDNAコントロール領域を145個の個人のサブセットで配列決定しました。異なる豚の品種の一部のサンプルも分析されました。612の公開されたmtDNAシーケンスも考慮して得られた結果は、（i）ほとんどの集団が同様に区別されていることを示唆していますが、アルプスに沿って主要な不連続性が見られます。（ii）イタリアの人口を除いて、ヨーロッパの野生のイノシシは、氷河後の人口統計拡大の署名を示しています。（iii）イタリアの人口は、氷河期の多様性の高い割合を維持しているようです。（iv）過去数世紀の一部の地域で発生した人口統計学的衰退は、遺伝的変異の顕著な減少をもたらしませんでした。（v）集団間のヒト媒介遺伝子の流れの兆候は弱いが、一部の領域では転座の効果が検出可能であり、低い豚のgrog程を特定できる。（vi）イタリアの独立した家畜化センターの仮説は、私たちのデータによって裏付けられていません。これにより、中央ヨーロッパの野生のイノシシが国内の品種の重要な源である可能性があることを確認しています。したがって、最近の人間の活動は野生のイノシシの遺伝的構造に限られた影響を及ぼしたと結論付けることができます。変動と分化の高い領域は、遺伝的多様性の自然な貯水池を表して、転座を避けて保護されています。この文脈では、狩猟によって一部の集団を制御することは、この種の遺伝的変異に大きな影響を与えるとは予想されていません。

The European wild boar is an important game species, subjected to local extinctions and translocations in the past, and currently enormously and worryingly expanding in some areas where management is urgently required. Understanding the relative roles of ancient and recent events in shaping the genetic structure of this species is therefore not only an interesting scientific issue, but it represents also the basis for addressing future management strategies. In addition, several pig breeds descend from the European wild boar, but the geographical location of the domestication area(s) and the possible introgression of pig genomes into wild populations are still open questions. Here, we analysed the genetic variation in different wild boar populations in Europe. Ten polymorphic microsatellites were typed in 252 wild boars and the mtDNA control region was sequenced in a subset of 145 individuals. Some samples from different pig breeds were also analysed. Our results, which were obtained considering also 612 published mtDNA sequences, suggest that (i) most populations are similarly differentiated, but the major discontinuity is found along the Alps; (ii) except for the Italian populations, European wild boars show the signature of a postglacial demographic expansion; (iii) Italian populations seem to preserve a high proportion of preglaciation diversity; (iv) the demographic decline which occurred in some areas in the last few centuries did not produce a noticeable reduction of genetic variation; (v) signs of human-mediated gene flow among populations are weak, although in some regions the effects of translocations are detectable and a low degree of pig introgression can be identified; (vi) the hypothesis of an independent domestication centre in Italy is not supported by our data, which in turn confirm that Central European wild boar might have represented an important source for domestic breeds. We can therefore conclude that recent human activities had a limited effect on the wild boar genetic structure. It follows that areas with high variation and differentiation represent natural reservoirs of genetic diversity to be protected avoiding translocations. In this context controlling some populations by hunting is not expected to affect significantly genetic variation in this species.