多孔質ポリマー吸着剤の分子動力学シミュレーションの合理的な表面設計

シミュレーションボックス内の非フラットアガロース表面の構造と使用と、数学物理学が非薄膜アガロース表面にデキストランポリマー鎖のセットを固定するための基準の採用とともに、数学的物理学が不動の基準と互換性があるものと互換性があります。平らなアガロース表面上の同じデキストランポリマー鎖のセットは、シミュレーションボックスが平らで非フラットアガロース表面を使用する場合に同じ横方向に沿って線形寸法に沿って線形寸法を持つ分子動力学シミュレーションを使用して生成することが示されています。最も外側の表面と多孔質媒体の最も外側の表面の近くにある細孔サイズは、非フラット表面を特徴付けるパラメーターのバリエーションを通じて間接的な方法で制御できます。目的の大きな細孔を生成するために非フラット表面を使用するには、シミュレーションボックス内の溶媒分子の数が小さくまたは適度な増加のみを必要としますが、同じ望ましい大きな細孔を構築するために平らな表面を使用すると、大幅な増加が必要です。平らな表面の線形寸法のサイズ。これにより、溶媒分子の数が大幅に増加し、計算負荷が扱いにくくなります。この作業の結果は、非フラットサーフェスを使用することにより、望ましいサイズの毛穴を持つ多孔質デキストランポリマー層を効果的に構築できることを示しており、このアプローチは、効果的に促進できるポリマーベースの多孔質吸着媒体の設計と構築に使用できることを示しています。コンポーネントの混合物から分離しなければならない関心のある吸着生体分子の輸送と吸着。既知の分子サイズの関心のある吸着生物分子であるために、有用な吸着剤培地になるために、多孔質ポリマー構造が持つ必要がある特性に関する有用な定義が提示され、（1）生成された多孔質ポリマー構造を評価するために使用されます。さまざまな非フラット表面モデルを採用し、（2）有望な多孔質構造の生産に効果的な一連の非フラット表面モデルから非フラット表面モデルを決定および選択します。次に、選択した非炎表面モデルを使用して多孔質ポリマー培地のセットが生成される手順が提示され、このセットからの目的の多孔質構造が決定され、選択されたものの輸送および固定化に使用されると見なすことができます。アフィニティグループ/リガンド、およびその後の輸送と吸着を分離する必要のある吸着。

The construction and use of nonflat agarose surfaces in a simulation box, together with the employment of criteria for the immobilization of a set of dextran polymer chains on the nonflat agarose surfaces whose mathematical physics is compatible with that of the criteria used for the immobilization of the same set of dextran polymer chains on flat agarose surfaces, are shown to generate, through the use of molecular dynamics simulations whose simulation box has linear dimensions along the lateral directions that are the same when flat and nonflat agarose surfaces are used, dextran porous polymer structures whose pore sizes at the outermost surface and in the vicinity of the outermost surface of the porous medium can be controlled by an indirect manner through the variation of the parameters that characterize the nonflat surface. The use of a nonflat surface for the generation of desired large pores requires only a small or modest increase in the number of solvent molecules in the simulation box, while the use of a flat surface for the construction of the same desired large pores requires significant increases in the size of the linear dimensions of the flat surface. This increases so substantially the number of solvent molecules that the computational loads become intractable. The results in this work show that through the use of nonflat surfaces porous dextran polymer layers having pores of desired sizes can be effectively constructed, and this approach could be used for the design and construction of polymer-based porous adsorbent media that could effectively facilitate the transport and adsorption of an adsorbate biomolecule of interest that must be separated from a mixture of components. A useful definition about the properties that a porous polymer structure must have in order to become, for an adsorbate biomolecule of interest of known molecular size, a useful adsorbent medium, is presented and is used to (1) evaluate the porous polymer structures generated through the employment of different nonflat surface models and (2) determine and select the nonflat surface model from a set of nonflat surface models that is effective in producing promising porous structures. Then a procedure is presented by which a set of porous polymer media is generated through the use of the selected nonflat surface model, and the desired porous structure from this set is determined and could be considered to be used for the transport and immobilization of the selected affinity groups/ligands and the subsequent transport and adsorption of the desired to be separated adsorbate.