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背景:ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)メソッドは、C型肝炎ウイルス(HCV)感染の診断、監視、治療に関連するデータを提供する上で重要な役割を果たします。リアルタイム逆転写PCR(RT-PCR)アッセイは、臨床応用のためのHCV RNAを定量化するという点で確立された有望なツールです。この研究は、臨床環境でのリアルタイムRT-PCRベースのテストのパフォーマンス特性を評価することを目的としています。 方法:検証と再現性テストは、標準パネルを使用して実行されました。197人の慢性HCV患者の血清は、リアルタイムRT-PCRアッセイによって分析され、結果はVersant BDNA3.0アッセイ(BDNA3.0)と比較されました。 結果:リアルタイムRT-PCRアッセイは、遺伝子型1b、2a、2b、および1b+2aに関する連続希釈液で許容可能な線形応答(R2 = 0.989-0.995)を示しました。HCVウイルス量は、リアルタイムRT-PCRアッセイにより、197人の患者全員(100%)で、194人(98.5%)でBDNA3.0で定量化できました。リアルタイムRT-PCRおよびBDNA3.0アッセイで測定されたHCV RNA定量化値は正の相関がありました(ピアソンの相関係数r = 0.734、p <0.001)。リアルタイムRT-PCRアッセイ値は、BDNA3.0の結果よりも平均0.13ログ高かった。遺伝子型1b、2a、2b、および混合を伴う相関係数は、それぞれ0.737、0.711、0.791および0.766でした(p <0.01)。 結論:リアルタイムRT-PCRアッセイは、HCVウイルス量の遺伝子型1および2 HCV感染の定量化に関してBDNA3.0と同等のパフォーマンスを示しました。
背景:ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)メソッドは、C型肝炎ウイルス(HCV)感染の診断、監視、治療に関連するデータを提供する上で重要な役割を果たします。リアルタイム逆転写PCR(RT-PCR)アッセイは、臨床応用のためのHCV RNAを定量化するという点で確立された有望なツールです。この研究は、臨床環境でのリアルタイムRT-PCRベースのテストのパフォーマンス特性を評価することを目的としています。 方法:検証と再現性テストは、標準パネルを使用して実行されました。197人の慢性HCV患者の血清は、リアルタイムRT-PCRアッセイによって分析され、結果はVersant BDNA3.0アッセイ(BDNA3.0)と比較されました。 結果:リアルタイムRT-PCRアッセイは、遺伝子型1b、2a、2b、および1b+2aに関する連続希釈液で許容可能な線形応答(R2 = 0.989-0.995)を示しました。HCVウイルス量は、リアルタイムRT-PCRアッセイにより、197人の患者全員(100%)で、194人(98.5%)でBDNA3.0で定量化できました。リアルタイムRT-PCRおよびBDNA3.0アッセイで測定されたHCV RNA定量化値は正の相関がありました(ピアソンの相関係数r = 0.734、p <0.001)。リアルタイムRT-PCRアッセイ値は、BDNA3.0の結果よりも平均0.13ログ高かった。遺伝子型1b、2a、2b、および混合を伴う相関係数は、それぞれ0.737、0.711、0.791および0.766でした(p <0.01)。 結論:リアルタイムRT-PCRアッセイは、HCVウイルス量の遺伝子型1および2 HCV感染の定量化に関してBDNA3.0と同等のパフォーマンスを示しました。
BACKGROUND: Polymerase chain reaction (PCR) methods play an essential role in providing data relating to diagnosis, monitoring and treatment of hepatitis C virus (HCV) infection. The real-time reverse transcription PCR (RT-PCR) assay is an established and promising tool in terms of quantifying HCV RNA for clinical application. This study aimed to evaluate the performance characteristics of a real-time RT-PCR-based test in a clinical setting. METHODS: Validation and reproducibility tests were performed using a standard panel. Sera from 197 chronic HCV patients were analyzed by the real-time RT-PCR assay and the results were compared with the Versant bDNA3.0 assay (bDNA3.0). RESULTS: The real-time RT-PCR assay showed an acceptable linear response (r2=0.989-0.995) in the serial dilutions regarding genotypes 1b, 2a, 2b and 1b+2a. HCV viral loads were quantifiable in all 197 patients (100%) by the real-time RT-PCR assay and in 194 (98.5%) by the bDNA3.0. HCV RNA quantification values measured by the real-time RT-PCR and bDNA3.0 assays were positively correlated (Pearson's correlation coefficient r=0.734, p<0.001). The real-time RT-PCR assay values were on average 0.13 logs higher than the bDNA3.0 results. The correlation coefficients with genotypes 1b, 2a, 2b and mixed were 0.737, 0.711, 0.791 and 0.766, respectively (p<0.01). CONCLUSIONS: The real-time RT-PCR assay showed comparable performance with bDNA3.0 regarding quantification of HCV viral loads with genotype 1 and 2 HCV infections.
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