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最近の技術的ブレークスルーにより、Saccharomyces cerevisiaeにおける数十万の遺伝的相互作用(GI)の定量化が可能になりました。これらのデータの解釈はしばしば困難ですが、GISの共同分析と補完的なデータ型によって改善することができます。ここでは、遺伝的および物理的相互作用データを統合する新しい方法論について説明します。私たちの方法を使用して、染色体生物学に関連する機能的モジュールのコレクションを特定し、それらの関係を調査します。結果のモジュールのマップが、個々の遺伝子のレベルと機能モジュールのレベルの両方で機能の解明の手がかりを提供する方法を示します。
最近の技術的ブレークスルーにより、Saccharomyces cerevisiaeにおける数十万の遺伝的相互作用(GI)の定量化が可能になりました。これらのデータの解釈はしばしば困難ですが、GISの共同分析と補完的なデータ型によって改善することができます。ここでは、遺伝的および物理的相互作用データを統合する新しい方法論について説明します。私たちの方法を使用して、染色体生物学に関連する機能的モジュールのコレクションを特定し、それらの関係を調査します。結果のモジュールのマップが、個々の遺伝子のレベルと機能モジュールのレベルの両方で機能の解明の手がかりを提供する方法を示します。
Recent technological breakthroughs allow the quantification of hundreds of thousands of genetic interactions (GIs) in Saccharomyces cerevisiae. The interpretation of these data is often difficult, but it can be improved by the joint analysis of GIs along with complementary data types. Here, we describe a novel methodology that integrates genetic and physical interaction data. We use our method to identify a collection of functional modules related to chromosomal biology and to investigate the relations among them. We show how the resulting map of modules provides clues for the elucidation of function both at the level of individual genes and at the level of functional modules.
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