大腸菌のATP結合カセットトランスポーター

ATP結合カセット（ABC）トランスポーターは、細胞膜を介して分子を積極的に輸送する不可欠な膜タンパク質です。大腸菌では、主にABC輸送体自体に加えて基質結合タンパク質と外膜受容体またはポリン、およびさまざまな機能を持つ多くのトランスポーターを含む輸入システムで構成されています。多くのATPaseドメイン、基質結合タンパク質、および全長輸送体の最近の結晶構造により、輸送の分子基盤に関する新しい洞察が得られました。バイオインフォマティクスアプローチにより、大腸菌におけるすべてのABCトランスポーターのおおよその識別と、他の既知のトランスポーターとの関係が可能になります。モデリングとシミュレーションを含む計算アプローチは、トランスポーターのダイナミクスに関する洞察を生み出し始めています。大腸菌における既知のABCトランスポーターの機能と、構造的および計算研究からの機械的洞察を要約します。

ATP-binding cassette (ABC) transporters are integral membrane proteins that actively transport molecules across cell membranes. In Escherichia coli they consist primarily of import systems that involve in addition to the ABC transporter itself a substrate binding protein and outer membrane receptors or porins, and a number of transporters with varied functions. Recent crystal structures of a number of ATPase domains, substrate binding proteins, and full-length transporters have given new insight in the molecular basis of transport. Bioinformatics approaches allow an approximate identification of all ABC transporters in E. coli and their relation to other known transporters. Computational approaches involving modeling and simulation are beginning to yield insight into the dynamics of the transporters. We summarize the function of the known ABC transporters in E. coli and mechanistic insights from structural and computational studies.