トマトの野生集団における干ばつ反応性遺伝子ASR2におけるヌクレオチド多型

ASR遺伝子ファミリー（膿瘍酸[ABA]、ストレス、熟成にちなんで名付けられた）は、植物ゲノムのみに存在し、転写調節に関与しています。そのメンバーは、根や塩ストレスのある植物の葉でアップレギュレートされています。以前の研究では、Solanum ChilenseとS. ArcanumのASR2について、適応進化の証拠（同義語および非同義の発散率から推測）が報告されています。この論文では、S。chilenseおよびS. arcanumのASR2およびリンクされていない遺伝子座CT114の種内ヌクレオチド変動のパターンを調査します。ASR2のヌクレオチドの多様性の程度は、1桁以上の種間で異なっていました。どちらの種でも、非中立進化の証拠を検出しました。これは、ユニークな気候の特徴に潜在的に関連する、または人口統計イベントに潜在的に関連するさまざまな選択的体制に起因する可能性があります。結果は、人口統計的および選択的仮説に照らして議論されています。

The Asr gene family (named after abscicic acid [ABA], stress, ripening), exclusively present in plant genomes, is involved in transcriptional regulation. Its members are up-regulated in roots and leaves of water- or salt-stressed plants. In previous work, evidence of adaptive evolution (as inferred from synonymous and nonsynonymous divergence rates) has been reported for Asr2 in Solanum chilense and S. arcanum, two species dwelling in habitats with different precipitation regimes. In this paper we investigate patterns of intraspecific nucleotide variation in Asr2 and the unlinked locus CT114 in S. chilense and S. arcanum. The extent of nucleotide diversity in Asr2 differed between species in more than one order of magnitude. In both species we detected evidence of non-neutral evolution, which may be ascribed to different selective regimes, potentially associated to unique climatic features, or, alternatively, to demographic events. The results are discussed in the light of demographic and selective hypotheses.