ジシストロウイルスゲノムの5 'UTR内の非定型のIRES

細胞mRNAの大部分の翻訳開始は、mRNAの5 '末端のキャップ構造によって媒介され、キャップへの開始因子の結合が含まれ、その後40年代のリボソームサブユニットの動員が続きます。ただし、多くのウイルスmRNAは、内部開始と呼ばれる代替メカニズムを使用して翻訳されています。この場合、MRNAの5 '非翻訳領域（UTR）内の内部リボソームエントリ部位（IRES）構造に結合します。すべてのウイルスのIRE要素の間に共通の特徴はありませんが、ほとんどは広範な二次構造を含むと考えられており、これらの構造のいくつかはその機能にとって重要です。しかし、ジシストロウイルスであるRhopalosiphum PADIウイルスのゲノムの5 'UTRのIRES要素は、このパラダイムに挑戦しています。このIRESは、さまざまな翻訳システムで機能することが示されています。興味深いことに、このIRES要素の機能領域はほとんど構造化されておらず、5 'UTR内からの複数の領域がフルレングスシーケンスと同じように効率的に機能します。このレビューでは、この非定型IRES要素の特徴を他のIRES要素と比較して対比し、その可能な作用メカニズムについて説明します。

Translation initiation on the majority of cellular mRNAs is mediated by a cap structure on the 5' end of the mRNA and involves the binding of initiation factors to the cap, followed by recruitment of the 40S ribosomal subunit. However, a number of viral mRNAs are translated using an alternative mechanism, termed internal initiation. In this case, initiation factors and the 40S subunit bind to an internal ribosome entry site (IRES) structure within the 5' untranslated region (UTR) of the mRNA. Although there is no common feature amongst all viral IRES elements, most are believed to contain extensive secondary structure and some of these structures are important for their function. However, an IRES element from the 5' UTR of the genome of Rhopalosiphum padi virus, a Dicistrovirus, challenges this paradigm. This IRES has been shown to function in a number of different translation systems. Intriguingly, the functional region of this IRES element is largely unstructured, and multiple regions from within the 5' UTR function as efficiently as the full-length sequence. This review compares and contrasts the features of this atypical IRES element with other IRES elements and discusses its possible mechanism of action.