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FEMS microbiology letters2008Nov01Vol.288issue(2)

以前は「actinomyces naeslundii genospecies 1および2」と命名されたActinomyces naeslundiiとActinomyces orisのシアリダーゼ(NANH)とActinomyces oris間の組換えの証拠

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

ヒト経口バイオフィルムの主なメンバーであるActinomyces spp。は、細胞外シアリダーゼを使用して、接着、脱グロシル酸免疫グロブリン、栄養素の解放を促進することができます。Actinomyces oris(n = 74)、Actinomyces naeslundii(n = 30)、アクティノマイセスviscosus(n = 1)およびアクチノマイセスジョンソンイ(n = 2)からの部分的なNANH遺伝子配列(1,077 bp)、活性標本領域と細菌のジョンソンイ(n = 2)ニューラミニダーゼリピート(BNR)を比較しました。シーケンスは整列し、各種は中間位置を持つ5つの分離株を持つ明確なクラスターを形成しました。これらの5つの分離株(2つのA. orisと3つのA. naeslundii)は、種間組換えを示しました。非同義語/同義語の比率は、A。OrisとA. Naeslundiiの両方で<1で、両方の種のNANHが選択的圧力を安定化していることを示しています。非同義の突然変異は選択されていません。しかし、A。orisの場合、中性選択のテストで有意な負の値は、A。orisの突然変異率がA. naeslundiiよりも大きいことを示唆していますが、非同義の変異に対する選択がありました。これは、A。naeslundiiの単形であったA. orisの多型部位の頻度が、A。naeslundiiの多型部位の頻度よりも有意に大きいという観察によって支持されました。7.011;経口バイオフィルムにおけるA. orisのより高い割合は、環境ストレスにうまく反応する能力の向上を促進する高い突然変異率によって説明される可能性があります。

ヒト経口バイオフィルムの主なメンバーであるActinomyces spp。は、細胞外シアリダーゼを使用して、接着、脱グロシル酸免疫グロブリン、栄養素の解放を促進することができます。Actinomyces oris(n = 74)、Actinomyces naeslundii(n = 30)、アクティノマイセスviscosus(n = 1)およびアクチノマイセスジョンソンイ(n = 2)からの部分的なNANH遺伝子配列(1,077 bp)、活性標本領域と細菌のジョンソンイ(n = 2)ニューラミニダーゼリピート(BNR)を比較しました。シーケンスは整列し、各種は中間位置を持つ5つの分離株を持つ明確なクラスターを形成しました。これらの5つの分離株(2つのA. orisと3つのA. naeslundii)は、種間組換えを示しました。非同義語/同義語の比率は、A。OrisとA. Naeslundiiの両方で<1で、両方の種のNANHが選択的圧力を安定化していることを示しています。非同義の突然変異は選択されていません。しかし、A。orisの場合、中性選択のテストで有意な負の値は、A。orisの突然変異率がA. naeslundiiよりも大きいことを示唆していますが、非同義の変異に対する選択がありました。これは、A。naeslundiiの単形であったA. orisの多型部位の頻度が、A。naeslundiiの多型部位の頻度よりも有意に大きいという観察によって支持されました。7.011;経口バイオフィルムにおけるA. orisのより高い割合は、環境ストレスにうまく反応する能力の向上を促進する高い突然変異率によって説明される可能性があります。

Actinomyces spp., predominant members of human oral biofilms, may use extracellular sialidase to promote adhesion, deglycosylate immunoglobulins and liberation of nutrients. Partial nanH gene sequences (1,077 bp) from Actinomyces oris (n=74), Actinomyces naeslundii (n=30), Actinomyces viscosus (n=1) and Actinomyces johnsonii (n=2) which included the active-site region and the bacterial neuraminidase repeats (BNRs) were compared. The sequences were aligned and each species formed a distinct cluster with five isolates having intermediate positions. These five isolates (two A. oris and three A. naeslundii) exhibited interspecies recombination. The nonsynonymous/synonymous ratio was <1 for both A. oris and A. naeslundii indicating that nanH in both species is under stabilizing selective pressure; nonsynonymous mutations are not selected. However, for A. oris significant negative values in tests for neutral selection suggested the rate of mutation in A. oris was greater than in A. naeslundii but with selection against nonsynonymous mutations. This was supported by the observation that the frequency of polymorphic sites in A. oris, which were monomorphic in A. naeslundii was significantly greater than the frequency of polymorphic sites in A. naeslundii which were monomorphic in A. oris (chi(2)=7.011; P=0.00081). The higher proportions of A. oris in the oral biofilm might be explained by the higher mutation rate facilitating an increased ability to respond successfully to environmental stress.

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