サイレンサーは、リクルートメントとは無関係に沈黙したクロマチンの集合を促進します

Saccharomyces cerevisiaeでは、沈黙したクロマチンがテロメアとサイレント交配型の遺伝子座HMRおよびHMLで発生します。これらの部位では、SIRタンパク質がサイレンサーに補充され、隣接するクロマチンと関連しています。クロマチン免疫沈降を使用して、さまざまなゲノム位置でのSIRタンパク質アセンブリの速度を比較し、沈黙したクロマチンの確立がテロメアVI-RよりもHMRよりもはるかに速いことを発見しました。サイレンシングされたクロマチンは、HMR-Eの片側でもう一方の側よりも速く組み立てられました。拡散の違いにもかかわらず、SIRタンパク質は同等の速度でHMR-Eおよびテロメアのサイレンサーに募集されました。さらに、テロメアVI-Rに隣接するHMR-Eの挿入は、テロメアとのSIR2P関連の割合を増加させました。これらのデータは、HMR-EがSirタンパク質を募集し、いくつかのキロ塩でのアセンブリを促進することの両方に機能することを示唆しています。SIR2Pの関連はHMR全体で同時に発生し、HMRでのサイレンシングは触媒的に不活性なSiR2Pの共発現に鈍感であることを、HMR-Eが非線形式で発生することを可能にすることを示唆しています。サイレンサーがいくつかのキロ塩とサイレンシングクロマチンのアセンブリを促進する能力は、正しいゲノム位置で不安定なクロマチンとなるものを維持するための重要なメカニズムである可能性があります。

In Saccharomyces cerevisiae, silenced chromatin occurs at telomeres and the silent mating-type loci HMR and HML. At these sites, the Sir proteins are recruited to a silencer and then associate with adjacent chromatin. We used chromatin immunoprecipitation to compare the rates of Sir protein assembly at different genomic locations and discovered that establishment of silenced chromatin was much more rapid at HMR than at the telomere VI-R. Silenced chromatin also assembled more quickly on one side of HMR-E than on the other. Despite differences in spreading, the Sir proteins were recruited to HMR-E and telomeric silencers at equivalent rates. Additionally, insertion of HMR-E adjacent to the telomere VI-R increased the rate of Sir2p association with the telomere. These data suggest that HMR-E functions to both recruit Sir proteins and promote their assembly across several kilobases. Observations that association of Sir2p occurs simultaneously throughout HMR and that silencing at HMR is insensitive to coexpression of catalytically inactive Sir2p suggest that HMR-E acts by enabling assembly to occur in a nonlinear fashion. The ability of silencers to promote assembly of silenced chromatin over several kilobases is likely an important mechanism for maintaining what would otherwise be unstable chromatin at the correct genomic locations.