ペプチドのタンデム質量分析における蓋とCID活性化モードの比較

私たちは、現在一般的にプロテオーム研究所で入手できるESI-QQTOFやMALDI-TOF/TOF機器など、MSおよびMS/MSモードで動作する高性能TOF機器で実行されたペプチド断片化の体系的な調査への貢献を報告します。前者のアナライザーの構成は低エネルギー衝突誘発性解離（CID）を提供するのに対し、後者は選択した親イオンの調整可能な活性化方法を可能にし、メタスト可能なレーザー誘導解離（蓋）または高エネルギーCID（ 'ガスのスペクトル用ガス）を誘導することができます'）。53ペプチド（FW 807-2853 g/mol）のモノプレトン化イオンの断片化は、ESI-QTOF質量分析計（水）の低エネルギーCIDと、Maldi Ultraflex Mass Spectrometertertertertertertertertertertermeterの高エネルギーCIDおよび蓋条件で行われました。（ブルーカー）。MS/MSスペクトルの体系的な比較は、効率的なペプチドシーケンスのための各機器のパフォーマンスに関する有用な情報と、観察された断片化行動に関する洞察を提供しました。

We report our contribution to the systematic investigation of peptide fragmentations performed on high-performance Tof equipment, operating in MS and MS/MS modes, such as ESI-QqTof and MALDI-Tof/Tof instruments that are commonly available today in proteomic laboratories. Whereas the former analyzer's configuration provides low-energy collision-induced dissociations (CID), the latter allows tunable activation methods of the selected parent ion to induce either metastable laser-induced dissociations (LID) or high-energy CID ('gas on spectra LID'). Fragmentation of the monoprotonated ion of 53 peptides (FW 807-2853 g/mol) was undertaken upon low-energy CID on an ESI-QTof mass spectrometer (Waters) as well as high-energy CID and LID conditions on a MALDI Ultraflex mass spectrometer (Bruker). Systematic comparison of MS/MS spectra provided useful information on the performance of each piece of equipment for efficient peptide sequencing and also insights into the observed fragmentation behaviors.