バクテリオファージT4のRNA処理と減衰

バクテリオファージT4は、毒性ファージの原型です。それは、宿主機能をその利益に覆し、そのゲノムの発現を課すために非常に効率的な戦略を進化させました。T4は、宿主とファージにエンコードされたRNaseと因子の組み合わせを使用して、段階に依存する方法でmRNAを分解します。ホストエンドヌクレアーゼRNase Eは、ファージの発達を通して使用されます。リボソームタンパク質S1に関連した配列固有のT4エンコードREGBエンドリボヌクレアーゼ機能は、初期転写産物を機能的に不活性化し、それらの分解を促進します。T4ポリヌクレオチドキナーゼは、このプロセスで役割を果たしています。その後、ウイルス因子DMDは、ホストRNase LSによる中間および後期mRNAを劣化から保護します。T4は、8つのTRNAのセットと、ファージ毒性に寄与する可能性のある未知の機能の2つの小さく安定したRNAをコードします。それらの成熟は宿主酵素によって保証されますが、それらのいくつかの生合成には1つのファージ係数CEFが必要です。TRNA遺伝子クラスターは、TRNA遺伝子を他のT4関連ファージに拡散させる原因となるホーミングDNAエンドヌクレアーゼSEGBをコードします。

Bacteriophage T4 is the archetype of virulent phage. It has evolved very efficient strategies to subvert host functions to its benefit and to impose the expression of its genome. T4 utilizes a combination of host and phage-encoded RNases and factors to degrade its mRNAs in a stage-dependent manner. The host endonuclease RNase E is used throughout the phage development. The sequence-specific, T4-encoded RegB endoribonuclease functions in association with the ribosomal protein S1 to functionally inactivate early transcripts and expedite their degradation. T4 polynucleotide kinase plays a role in this process. Later, the viral factor Dmd protects middle and late mRNAs from degradation by the host RNase LS. T4 codes for a set of eight tRNAs and two small, stable RNA of unknown function that may contribute to phage virulence. Their maturation is assured by host enzymes, but one phage factor, Cef, is required for the biogenesis of some of them. The tRNA gene cluster also codes for a homing DNA endonuclease, SegB, responsible for spreading the tRNA genes to other T4-related phage.