RNA分解における3'-5 '外核の役割

RNA分解は、RNAレベルを制御する主要なプロセスであり、細胞代謝において中心的な役割を果たします。不安定なメッセンジャーRNAから、より安定した非コーディングRNA（主にrRNAとtRNAだけでなく、拡大する小さな調節RNA）まで、すべての分子は最終的に分解されます。余分な転写産物の除去には、発現が不要なRNAが含まれますが、欠陥のあるRNAの除去も含まれます。その結果、RNAの分解は、RNA品質制御メカニズムに固有のステップです。さらに、細胞内のヌクレオチドプールのリサイクルに貢献します。大腸菌には、複数のRNA代謝経路に関与している8つの3'-5 'エクソリボヌクレアーゼがあります。ただし、ポリヌクレオチドホスホリラーゼ（PNPase）、リボヌクレアーゼII（RNase II）、RNase R、およびオリゴリボヌクレアーゼのすべてのRNA分解活性を達成しているのは、4つのエクソリボヌクレアーゼのみです。ここでは、さまざまな基質の分解における細菌3'-5 'エクソリボヌクレアーゼの役割に関する利用可能な情報を要約し、これらの分解酵素の動作モードの理解に貢献した最新のデータを強調します。

RNA degradation is a major process controlling RNA levels and plays a central role in cell metabolism. From the labile messenger RNA to the more stable noncoding RNAs (mostly rRNA and tRNA, but also the expanding class of small regulatory RNAs) all molecules are eventually degraded. Elimination of superfluous transcripts includes RNAs whose expression is no longer required, but also the removal of defective RNAs. Consequently, RNA degradation is an inherent step in RNA quality control mechanisms. Furthermore, it contributes to the recycling of the nucleotide pool in the cell. Escherichia coli has eight 3'-5' exoribonucleases, which are involved in multiple RNA metabolic pathways. However, only four exoribonucleases appear to accomplish all RNA degradative activities: polynucleotide phosphorylase (PNPase), ribonuclease II (RNase II), RNase R, and oligoribonuclease. Here, we summarize the available information on the role of bacterial 3'-5' exoribonucleases in the degradation of different substrates, highlighting the most recent data that have contributed to the understanding of the diverse modes of operation of these degradative enzymes.