大腸炎微生物叢におけるFaecalibacterium prausnitziiの低いカウント

背景：腸内微生物叢は、大腸炎、特に炎症性腸疾患（IBD）の病因において役割を果たすと疑われています。目的は、大腸炎患者の糞便微生物叢の組成と健康な被験者（HS）の糞便微生物叢の組成を比較することでした。 方法：22人の活動性クローン病（A-CD）患者、寛解中の10人のCD患者（R-CD）、13人の活動性潰瘍性大腸炎（A-UC）患者、寛解中4人のUC患者（R-UC）、8人の糞便サンプル感染性大腸炎（IC）患者、および27 HSは、16S RRNA遺伝子を標的とする定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（PCR）によって分析されました。細菌数は、統計分析のために対数（ログ（10）CFU）に変換されました。 結果：HS（10.8）と比較して、A-IBD患者（9.7; p = 0.004）およびIC（9.4; p = 0.02）では、門門の骨材（クロストリジウム液体およびCoctridium coccoides基）の細菌はあまり表現されていませんでした。Faecalibacterium prausnitzii種（C. leptum群の主要な代表）は、HSと比較してA-IBDおよびIC患者のカウントが低かった（8.8および8.3対10.4; P = 0.0004およびP = 0.003）。A-IBD（1.3; p = 0.0001）およびIC患者（0.4; p = 0.002）では、硬質/バクテロイド酸塩の比率が低かった。HSと比較して、BifidobacteriaはA-IBDおよびICであまり表現されていませんでした（7.9および7.7対9.2; P = 0.001およびP = 0.01）。 結論：IBD患者の糞便微生物叢は、HSの患者とは異なります。門は、特にF. prausnitzii種の堅固なものが、A-IBD患者とIC患者で過小評価されています。F. prausnitziiの低い数は一貫して腸粘膜の保護と一貫して関連しているため、これらの細菌は腸の恒常性にとって重要です。

BACKGROUND: The intestinal microbiota is suspected to play a role in colitis and particularly in inflammatory bowel disease (IBD) pathogenesis. The aim was to compare the fecal microbiota composition of patients with colitis to that of healthy subjects (HS). METHODS: fecal samples from 22 active Crohn's disease (A-CD) patients, 10 CD patients in remission (R-CD), 13 active ulcerative colitis (A-UC) patients, 4 UC patients in remission (R-UC), 8 infectious colitis (IC) patients, and 27 HS were analyzed by quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) targeting the 16S rRNA gene. Bacterial counts were transformed to logarithms (Log(10) CFU) for statistical analysis. RESULTS: Bacteria of the phylum Firmicutes (Clostridium leptum and Clostridium coccoides groups) were less represented in A-IBD patients (9.7; P = 0.004) and IC (9.4; P = 0.02), compared to HS (10.8). Faecalibacterium prausnitzii species (a major representative of the C. leptum group) had lower counts in A-IBD and IC patients compared to HS (8.8 and 8.3 versus 10.4; P = 0.0004 and P = 0.003). The Firmicutes/Bacteroidetes ratio was lower in A-IBD (1.3; P = 0.0001) and IC patients (0.4; P = 0.002). Compared to HS, Bifidobacteria were less represented in A-IBD and IC (7.9 and 7.7 versus 9.2; P = 0.001 and P = 0.01). CONCLUSIONS: The fecal microbiota of patients with IBD differs from that of HS. The phylum Firmicutes and particularly the species F. prausnitzii, are underrepresented in A-IBD patients as well as in IC patients. These bacteria could be crucial to gut homeostasis since lower counts of F. prausnitzii are consistently associated with a reduced protection of the gut mucosa.