MetaBoanalyst：メタボロミックデータ分析と解釈のためのWebサーバー

メタボロミクスは、NMR、クロマトグラフィー、質量分析を使用して多数の代謝物を特徴付けることに関係する「Omics」研究の新たに新たな分野です。バイオマーカーの識別と、細胞、組織、または生物の代謝プロファイリングで頻繁に使用されます。メタボロミクスにおけるデータ処理の課題は非常にユニークであり、多くの場合、特殊な（または高価な）データ分析ソフトウェアと、化学情報学、バイオインフォマティクス、統計に関する詳細な知識が必要です。メタボロミックデータ分析を簡素化すると同時に、ユーザーのアクセシビリティを改善すると同時に、メタボアナリストと呼ばれるメタボロミックデータ分析用の自由にアクセスしやすいWebサーバーを開発しました。基本的に、MetaBoanalystは、今日のWebベースのマイクロアレイ分析パッケージの多くとは異なり、Webベースのメタボロミックデータ処理ツールです。さまざまな入力データ（NMRピークリスト、ビン型スペクトル、MSピークリスト、化合物/濃度データ）をさまざまな形式で受け入れます。また、メタボロミックデータ処理、データ正規化、多変量統計分析、グラフ化、代謝産物の識別、経路マッピングのための多くのオプションも提供します。特に、MetaBoanalystは、折り畳み変化分析、t検定、PCA、PLS-DA、階層クラスタリング、およびより洗練された統計学習または機械学習方法などの手法をサポートしています。また、ほとんどの種類の入力スペクトルからの複合識別を容易にするために、参照スペクトルの大きなライブラリを採用しています。MetaBoanalystは、さまざまなメニュー、情報ハイパーリンク、チェックボックスを使用して、段階的な分析パイプラインを使用してユーザーをガイドします。完了すると、サーバーは、グラフィックおよび表形式の出力で埋め込まれた使用された各メソッドを説明する詳細なレポートを生成します。Metaboanalystは、ほとんどの種類のメタボロミックデータを処理でき、一般的な種類のメタボロミックデータ分析のほとんどを実行するように設計されています。MetaBoanalystはhttp://www.metaboanalyst.caでアクセスできます。

Metabolomics is a newly emerging field of 'omics' research that is concerned with characterizing large numbers of metabolites using NMR, chromatography and mass spectrometry. It is frequently used in biomarker identification and the metabolic profiling of cells, tissues or organisms. The data processing challenges in metabolomics are quite unique and often require specialized (or expensive) data analysis software and a detailed knowledge of cheminformatics, bioinformatics and statistics. In an effort to simplify metabolomic data analysis while at the same time improving user accessibility, we have developed a freely accessible, easy-to-use web server for metabolomic data analysis called MetaboAnalyst. Fundamentally, MetaboAnalyst is a web-based metabolomic data processing tool not unlike many of today's web-based microarray analysis packages. It accepts a variety of input data (NMR peak lists, binned spectra, MS peak lists, compound/concentration data) in a wide variety of formats. It also offers a number of options for metabolomic data processing, data normalization, multivariate statistical analysis, graphing, metabolite identification and pathway mapping. In particular, MetaboAnalyst supports such techniques as: fold change analysis, t-tests, PCA, PLS-DA, hierarchical clustering and a number of more sophisticated statistical or machine learning methods. It also employs a large library of reference spectra to facilitate compound identification from most kinds of input spectra. MetaboAnalyst guides users through a step-by-step analysis pipeline using a variety of menus, information hyperlinks and check boxes. Upon completion, the server generates a detailed report describing each method used, embedded with graphical and tabular outputs. MetaboAnalyst is capable of handling most kinds of metabolomic data and was designed to perform most of the common kinds of metabolomic data analyses. MetaboAnalyst is accessible at http://www.metaboanalyst.ca.