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ショウジョウバエのメラノガスターは、生合成のメカニズムに従って分類される3つのクラスの小さなRNAを表現しています。マイクロRNAは約22〜23ヌクレオチド（NT）であり、Drosha/PashaおよびDCR-1/Loquasiousコンプレックスによるヘアピンのような前駆体から連続的に処理される小さなRNAを遍在して発現しました。マイクロRNAは通常、AGO1と関連し、タンパク質コーディング遺伝子の発現を調節します。約24-28 NTのPIWIファミリータンパク質と関連するPIWI相互作用RNA（PIRNA）は、一本鎖前駆体から生じる可能性があります。トランスポゾンサイレンシングでピルナ機能があり、主に生殖腺組織に限定されています。エンドシルナは、生殖系組織と体性組織の両方に見られます。これらの約21 nt RNAは、異なるダイカーであるDCR-2によって生成され、Drosha/Pasha複合体に依存しません。それらは主にAgo2に結合し、モバイル要素とタンパク質コーディング遺伝子の両方を標的とします。驚くべきことに、エンドシルナのサブセットは、dsRNA結合タンパク質葉（LOQ）での産生に強く依存しており、一般的にDCR-1のパートナーであり、miRNA生合成の補因子であると考えています。Endo-siRNAの生成は、MicroRNAの生産に必要な特定のLOQ ISOFOMであるLOQS-PDに依存します。LOQSPD。異なる小RNAクラスの生物発生における役割に並行して、LOQS-PDおよびLOQS-PBは異なるDicerタンパク質に結合し、DCR-1/LOQS-PB複合体とDCR-2/LOQS-PD複合体を駆動するMicroRNAおよびEndo-siRNA生合成を駆動します、 それぞれ。
ショウジョウバエのメラノガスターは、生合成のメカニズムに従って分類される3つのクラスの小さなRNAを表現しています。マイクロRNAは約22〜23ヌクレオチド（NT）であり、Drosha/PashaおよびDCR-1/Loquasiousコンプレックスによるヘアピンのような前駆体から連続的に処理される小さなRNAを遍在して発現しました。マイクロRNAは通常、AGO1と関連し、タンパク質コーディング遺伝子の発現を調節します。約24-28 NTのPIWIファミリータンパク質と関連するPIWI相互作用RNA（PIRNA）は、一本鎖前駆体から生じる可能性があります。トランスポゾンサイレンシングでピルナ機能があり、主に生殖腺組織に限定されています。エンドシルナは、生殖系組織と体性組織の両方に見られます。これらの約21 nt RNAは、異なるダイカーであるDCR-2によって生成され、Drosha/Pasha複合体に依存しません。それらは主にAgo2に結合し、モバイル要素とタンパク質コーディング遺伝子の両方を標的とします。驚くべきことに、エンドシルナのサブセットは、dsRNA結合タンパク質葉（LOQ）での産生に強く依存しており、一般的にDCR-1のパートナーであり、miRNA生合成の補因子であると考えています。Endo-siRNAの生成は、MicroRNAの生産に必要な特定のLOQ ISOFOMであるLOQS-PDに依存します。LOQSPD。異なる小RNAクラスの生物発生における役割に並行して、LOQS-PDおよびLOQS-PBは異なるDicerタンパク質に結合し、DCR-1/LOQS-PB複合体とDCR-2/LOQS-PD複合体を駆動するMicroRNAおよびEndo-siRNA生合成を駆動します、 それぞれ。
Drosophila melanogaster expresses three classes of small RNAs, which are classified according to their mechanisms of biogenesis. MicroRNAs are approximately 22-23 nucleotides (nt), ubiquitously expressed small RNAs that are sequentially processed from hairpin-like precursors by Drosha/Pasha and Dcr-1/Loquacious complexes. MicroRNAs usually associate with AGO1 and regulate the expression of protein-coding genes. Piwi-interacting RNAs (piRNAs) of approximately 24-28 nt associate with Piwi-family proteins and can arise from single-stranded precursors. piRNAs function in transposon silencing and are mainly restricted to gonadal tissues. Endo-siRNAs are found in both germline and somatic tissues. These approximately 21-nt RNAs are produced by a distinct Dicer, Dcr-2, and do not depend on Drosha/Pasha complexes. They predominantly bind to AGO2 and target both mobile elements and protein-coding genes. Surprisingly, a subset of endo-siRNAs strongly depend for their production on the dsRNA-binding protein Loquacious (Loqs), thought generally to be a partner for Dcr-1 and a cofactor for miRNA biogenesis. Endo-siRNA production depends on a specific Loqs isoform, Loqs-PD, which is distinct from the one, Loqs-PB, required for the production of microRNAs. Paralleling their roles in the biogenesis of distinct small RNA classes, Loqs-PD and Loqs-PB bind to different Dicer proteins, with Dcr-1/Loqs-PB complexes and Dcr-2/Loqs-PD complexes driving microRNA and endo-siRNA biogenesis, respectively.
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