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Functional & integrative genomics2010Mar01Vol.10issue(1)

心臓のリズムの性依存性遺伝子調節ネットワーク

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
概要
Abstract

66個の選択された心臓リズム決定要因(HRD)遺伝子の発現レベル、コントロール、および相互調整を、4匹の雄および4匹の雌マウスの心房と心室で比較しました。さまざまなアドレナリン受容体、アンキリン、イオンチャネルおよびトランスポーター、コネキシン、カドヘリン、プラコフィリン、および挿入されたディスクのその他の成分をコードする遺伝子が、チャンバーに依存し、両性間で異なる複雑なネットワークを形成することがわかりました。さらに、AtriaのほとんどのHRD遺伝子は、女性よりも男性よりも高い発現を示しましたが、心室では、発現レベルは男性よりも女性の方がほとんど高かった。さらに、性別の間で有意なチャンバーの違いが観察され、男性の心室よりも心房の発現が高く、雌の心房よりも高い発現がありました。他のWeb遺伝子との発現調整の程度と発現の安定性として定義されたHRD遺伝子Web内のそれらの顕著な(新しい概念)に従って選択された遺伝子をランク付けしました。興味深いことに、著名な階層は2つの性別の間で実質的に異なっていました。まとめると、これらの発見は、心臓のリズムトランスクリプトームの組織原理が性に依存していることを示しており、新たに導入された顕著な分析により、性的二分法に極めて重要な遺伝子の識別を可能にします。

66個の選択された心臓リズム決定要因(HRD)遺伝子の発現レベル、コントロール、および相互調整を、4匹の雄および4匹の雌マウスの心房と心室で比較しました。さまざまなアドレナリン受容体、アンキリン、イオンチャネルおよびトランスポーター、コネキシン、カドヘリン、プラコフィリン、および挿入されたディスクのその他の成分をコードする遺伝子が、チャンバーに依存し、両性間で異なる複雑なネットワークを形成することがわかりました。さらに、AtriaのほとんどのHRD遺伝子は、女性よりも男性よりも高い発現を示しましたが、心室では、発現レベルは男性よりも女性の方がほとんど高かった。さらに、性別の間で有意なチャンバーの違いが観察され、男性の心室よりも心房の発現が高く、雌の心房よりも高い発現がありました。他のWeb遺伝子との発現調整の程度と発現の安定性として定義されたHRD遺伝子Web内のそれらの顕著な(新しい概念)に従って選択された遺伝子をランク付けしました。興味深いことに、著名な階層は2つの性別の間で実質的に異なっていました。まとめると、これらの発見は、心臓のリズムトランスクリプトームの組織原理が性に依存していることを示しており、新たに導入された顕著な分析により、性的二分法に極めて重要な遺伝子の識別を可能にします。

Expression level, control, and intercoordination of 66 selected heart rhythm determinant (HRD) genes were compared in atria and ventricles of four male and four female adult mice. We found that genes encoding various adrenergic receptors, ankyrins, ion channels and transporters, connexins, cadherins, plakophilins, and other components of the intercalated discs form a complex network that is chamber dependent and differs between the two sexes. In addition, most HRD genes in atria had higher expression in males than in females, while in ventricles, expression levels were mostly higher in females than in males. Moreover, significant chamber differences were observed between the sexes, with higher expression in atria than ventricles for males and higher expression in ventricles than atria for females. We have ranked the selected genes according to their prominence (new concept) within the HRD gene web defined as extent of expression coordination with the other web genes and stability of expression. Interestingly, the prominence hierarchy was substantially different between the two sexes. Taken together, these findings indicate that the organizational principles of the heart rhythm transcriptome are sex dependent, with the newly introduced prominence analysis allowing identification of genes that are pivotal for the sexual dichotomy.

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