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核オリゴマー化ドメイン（NOD）は、細菌成分を検出するためのサイトゾルパターン認識受容体（PRR）です。この研究では、草のcar冠nod1（gcnod1）と草のcar冠nod2（gcnod2）の分子クローニングとゲノム特性評価が報告されました。GCNOD1の完全なオープンリーディングフレームには、937アミノ酸ポリペプチドをコードする2814 bpが含まれています。GCNOD2 cDNA配列は、982-アミノ酸ポリペプチドをコードします。GCNOD1とGCNOD2には、Carboxyターミナルロイシンリッチリピート（LRR）ドメイン、中央NOD、NBSまたはNACHTドメイン、アミノ端子カードドメイン（NOD2の場合は2つ）の3つの保存ドメインがあります。ゲノムレベルでは、GCNOD1は11のエクソンで構成され、10個の介在イントロンがあり、約9 kbのゲノムシーケンスに及びます。一方、GCNOD2の長さは約5 kbで、9つの介在イントロンがあります。リアルタイムPCR分析により、GCNOD1とGCNOD2が成体組織で遍在的に発現していることが示されました。GCNOD1の最高の転写レベルは脳で検出されましたが、GCNOD2の頭部腎臓で検出されました。草のコイのレオウイルスは、脾臓におけるGCNOD1とGCNOD2の発現を有意に誘導しました（1日から6日目）。ただし、式プロファイルは時間コースの応答が異なりました。リポ多糖（LPS）、ペプチドグリカン（PGN）、およびpolyi：Cによる誘導実験により、血液中のGCNOD1およびGCNOD2の微分発現と調節が明らかになりました。これらすべてのデータは、細菌およびウイルス感染に対する魚の自然免疫保護におけるNOD1とNOD2の潜在的な役割を示唆しています。
核オリゴマー化ドメイン（NOD）は、細菌成分を検出するためのサイトゾルパターン認識受容体（PRR）です。この研究では、草のcar冠nod1（gcnod1）と草のcar冠nod2（gcnod2）の分子クローニングとゲノム特性評価が報告されました。GCNOD1の完全なオープンリーディングフレームには、937アミノ酸ポリペプチドをコードする2814 bpが含まれています。GCNOD2 cDNA配列は、982-アミノ酸ポリペプチドをコードします。GCNOD1とGCNOD2には、Carboxyターミナルロイシンリッチリピート（LRR）ドメイン、中央NOD、NBSまたはNACHTドメイン、アミノ端子カードドメイン（NOD2の場合は2つ）の3つの保存ドメインがあります。ゲノムレベルでは、GCNOD1は11のエクソンで構成され、10個の介在イントロンがあり、約9 kbのゲノムシーケンスに及びます。一方、GCNOD2の長さは約5 kbで、9つの介在イントロンがあります。リアルタイムPCR分析により、GCNOD1とGCNOD2が成体組織で遍在的に発現していることが示されました。GCNOD1の最高の転写レベルは脳で検出されましたが、GCNOD2の頭部腎臓で検出されました。草のコイのレオウイルスは、脾臓におけるGCNOD1とGCNOD2の発現を有意に誘導しました（1日から6日目）。ただし、式プロファイルは時間コースの応答が異なりました。リポ多糖（LPS）、ペプチドグリカン（PGN）、およびpolyi：Cによる誘導実験により、血液中のGCNOD1およびGCNOD2の微分発現と調節が明らかになりました。これらすべてのデータは、細菌およびウイルス感染に対する魚の自然免疫保護におけるNOD1とNOD2の潜在的な役割を示唆しています。
Nuclear oligomerization domains (NODs) are cytosolic pattern recognition receptors (PRRs) to detect bacterial component. In this study, the molecular cloning and genomic characterization of grass carp NOD1 (gcNOD1) and grass carp NOD2 (gcNOD2) were reported. The complete open reading frame of gcNOD1 contains 2814 bp, encoding a 937-amino acid polypeptide. The gcNOD2 cDNA sequence encodes 982-amino acid polypeptide. Both gcNOD1 and gcNOD2 possess three conserved domains: carboxy terminal leucine rich repeat (LRR) domains, a central NOD, NBS or NACHT domain, and an amino terminal CARD domain (two in the case of NOD2). At the genomic level, gcNOD1 consists of 11 exons, with 10 intervening introns, spanning approximately 9 kb of genomic sequence. Whereas gcNOD2 has a length of approximately 5 kb with 9 intervening introns. Real time PCR analysis showed gcNOD1 and gcNOD2 were ubiquitously expressed in adult tissues. The highest transcript level of gcNOD1 was detected in brain, but in head kidney for gcNOD2. Grass carp reovirus significantly induced the expression of gcNOD1 and gcNOD2 in spleen (from days 1 to 6). However, expression profiles differed in time course response. Induction experiments with lipopolysaccharide (LPS), peptidoglycan (PGN) and polyI:C revealed the differential expression and regulation of gcNOD1 and gcNOD2 in blood, head kidney, trunk kidney and spleen. All these data suggest a potential role of NOD1 and NOD2 in fish innate immune protection to bacterial and virus infections.
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