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International journal of systematic and evolutionary microbiology2011Jan01Vol.61issue(Pt 1)

Coralの粘液から分離されたMarinobacterium coralli sp nov(Mussismilia hispida)

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

ブラジルのサン・セバスティア・チャンネルにあるサンゴ礁ビルダーのサンゴ(ムスシスミリア・ヒスピダ)の粘液から、R-40509(t)と指定されたグラム陰性の好気性細菌が分離されました。株はオキシダーゼ陽性でカタラーゼ陰性であり、成長にNa(+)が必要でした。その系統発生の位置はマリノバクテリウム属にあり、最も近い種はマリノバクテリウム・セディミニコーラ、マリノバクテリウム・マリチムム、マリノバクテリウム・スタニエリでした。分離株は、これらの種の型株と97.5-98.0%の16S rRNA遺伝子配列の類似性を示しました。マリノバクテリウム属の他の型株との16S rRNA遺伝子配列の類似性は96%未満でした。株R-40509(T)とマリノバクテリウム属の系統発生的に最も近い種の型株の間のDNA-DNAハイブリダイゼーションは、70%未満のDNA-DNA関連性を明らかにし、株の新規種の状態を支持しました。表現型の特性評価により、株は15-42°Cで、最大9%NaClを含む培地で成長することができたことが明らかになりました。分離株は、d-アラニン、L-アラニン、ブロモスッチニン酸、β-ヒドロキシ酸酸、α-ケトバレア酸を利用する能力など、いくつかの特徴によって表現型に関連する種と区別できます。アセトイン(Voges-Proskauer)を生成しましたが、エステラーゼリパーゼ(C8)またはカタラーゼ活性はありませんでした。C(18:1)ω7C(35%)、合計機能3(ISO-C(15:0)2-OHおよび/またはC(16:1)ω7C; 25%)およびC(16:0)を所有しています。(22%)主要な細胞脂肪酸として。DNA G+C含有量は58.5 mol%でした。名前マリノバクテリウムcoralli sp。11月。この新しい分離株に対応するために提案されています。型ひずみはR-40509(t)(= LMG 25435(t)= CAIM 1449(t))です。

ブラジルのサン・セバスティア・チャンネルにあるサンゴ礁ビルダーのサンゴ(ムスシスミリア・ヒスピダ)の粘液から、R-40509(t)と指定されたグラム陰性の好気性細菌が分離されました。株はオキシダーゼ陽性でカタラーゼ陰性であり、成長にNa(+)が必要でした。その系統発生の位置はマリノバクテリウム属にあり、最も近い種はマリノバクテリウム・セディミニコーラ、マリノバクテリウム・マリチムム、マリノバクテリウム・スタニエリでした。分離株は、これらの種の型株と97.5-98.0%の16S rRNA遺伝子配列の類似性を示しました。マリノバクテリウム属の他の型株との16S rRNA遺伝子配列の類似性は96%未満でした。株R-40509(T)とマリノバクテリウム属の系統発生的に最も近い種の型株の間のDNA-DNAハイブリダイゼーションは、70%未満のDNA-DNA関連性を明らかにし、株の新規種の状態を支持しました。表現型の特性評価により、株は15-42°Cで、最大9%NaClを含む培地で成長することができたことが明らかになりました。分離株は、d-アラニン、L-アラニン、ブロモスッチニン酸、β-ヒドロキシ酸酸、α-ケトバレア酸を利用する能力など、いくつかの特徴によって表現型に関連する種と区別できます。アセトイン(Voges-Proskauer)を生成しましたが、エステラーゼリパーゼ(C8)またはカタラーゼ活性はありませんでした。C(18:1)ω7C(35%)、合計機能3(ISO-C(15:0)2-OHおよび/またはC(16:1)ω7C; 25%)およびC(16:0)を所有しています。(22%)主要な細胞脂肪酸として。DNA G+C含有量は58.5 mol%でした。名前マリノバクテリウムcoralli sp。11月。この新しい分離株に対応するために提案されています。型ひずみはR-40509(t)(= LMG 25435(t)= CAIM 1449(t))です。

A Gram-negative, aerobic bacterium, designated R-40509(T), was isolated from mucus of the reef builder coral (Mussismilia hispida) located in the São Sebastião Channel, São Paulo, Brazil. The strain was oxidase-positive and catalase-negative, and required Na(+) for growth. Its phylogenetic position was in the genus Marinobacterium and the closest related species were Marinobacterium sediminicola, Marinobacterium maritimum and Marinobacterium stanieri; the isolate exhibited 16S rRNA gene sequence similarities of 97.5-98.0 % with the type strains of these species. 16S rRNA gene sequence similarities with other type strains of the genus Marinobacterium were below 96 %. DNA-DNA hybridizations between strain R-40509(T) and the type strains of the phylogenetically closest species of the genus Marinobacterium revealed less than 70 % DNA-DNA relatedness, supporting the novel species status of the strain. Phenotypic characterization revealed that the strain was able to grow at 15-42 °C and in medium containing up to 9 % NaCl. The isolate could be differentiated from phenotypically related species by several features, including its ability to utilize d-alanine, l-alanine, bromosuccinic acid, β-hydroxybutyric acid and α-ketovaleric acid, but not acetate or l-arabinose. It produced acetoin (Voges-Proskauer), but did not have esterase lipase (C8) or catalase activities. It possessed C(18 : 1)ω7c (35 %), summed feature 3 (iso-C(15 : 0) 2-OH and/or C(16 : 1)ω7c; 25 %) and C(16 : 0) (22 %) as major cellular fatty acids. The DNA G+C content was 58.5 mol%. The name Marinobacterium coralli sp. nov. is proposed to accommodate this novel isolate; the type strain is R-40509(T) (=LMG 25435(T) =CAIM 1449(T)).

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