防腐剤エタノールからの標本のDNAの直接PCR増幅とシーケンス

DNA抽出は、多くの分子生物学プロトコルの最初のステップです。しかし、保存された標本からのDNAが防腐剤媒体に漏れ、媒体自体を直接PCR増幅することができると仮定しました。このアイデアは、多くのブランドのボトルに入れられ、実際に増幅可能な量のカタピラーDNAを取得した「ワーム」（毛虫）で有名なメスカル - アルコール飲料に関するテストに成功しました。次に、70の新たに収集された標本と7〜10年前の7つのアーカイブ標本の95％エタノール防腐剤からDNAを成功および配列決定しました。これらの結果は、DNA抽出が多くのプロトコルにおける余分なステップであり、防腐剤エタノールを非侵襲的サンプリングの遺伝物質の源として使用できることを示唆しています。

DNA extraction is the first step in many molecular biology protocols. However, we hypothesized that DNA from a preserved specimen can leak into its preservative medium, allowing the medium itself to be directly PCR-amplified. We successfully tested this idea on mescal-the alcoholic beverage famous for the "worm" (a caterpillar) that is placed in the bottle of many brands-and indeed obtained amplifiable quantities of caterpillar DNA. We then successfully amplified and sequenced DNA from the 95% ethanol preservative of 70 freshly collected specimens and 7 archival specimens 7-10 years old. These results suggest that DNA extraction is a superfluous step in many protocols and that preservative ethanol can be used as a source of genetic material for non-invasive sampling or when no tissue specimen is left for further DNA analyses.