シグマ活動の変調によるストレスと飢ation中の大腸菌の転写スイッチング

大腸菌の活発な成長中、転写活性の大部分はハウスキーピングSigma因子（Sigma（70））によって行われます。これは、コアRNAPとの関連性が高いため、Core RNAPに対するより高い親和性のために一般的に好まれています。栄養飢ation中の代替シグマ因子による転写を促進するために、細菌細胞は、シグマの転写能力（70）が可逆的に減少する複数の戦略を使用します。代替Sigma因子を支持してバランスをシフトする促進因子は、たまたま小分子（P）PPGPP（PPGPPまたはPPPGPP）、タンパク質（DKSA、RSD）、およびRNA種（6S RNA）と同じくらい多様です。6S RNAと（P）PPGPPは長い間文献で知られていましたが、転写スイッチングにおけるその役割は近年理解されています。DKSAの機能の解明により、厳しい応答の現象に新しい次元が追加されました。（P）PPGPP、DKSA、6S RNA、およびRSDの作用の最終結果は類似しているため、これらのメカニズムを集合的に分析する必要があります。（P）PPGPP、DKSA、RSD、および6S RNAによるSigma（70）の調節を理解する最近の傾向をレビューし、大腸菌のSigma（70）活性の変調によるRNAP再分配の統一モデルを進化させる症例を提示します。

During active growth of Escherichia coli, majority of the transcriptional activity is carried out by the housekeeping sigma factor (sigma(70)), whose association with core RNAP is generally favoured because of its higher intracellular level and higher affinity to core RNAP. In order to facilitate transcription by alternative sigma factors during nutrient starvation, the bacterial cell uses multiple strategies by which the transcriptional ability of sigma(70) is diminished in a reversible manner. The facilitators of shifting the balance in favour of alternative sigma factors happen to be as diverse as a small molecule (p)ppGpp (represents ppGpp or pppGpp), proteins (DksA, Rsd) and a species of RNA (6S RNA). Although 6S RNA and (p)ppGpp were known in literature for a long time, their role in transcriptional switching has been understood only in recent years. With the elucidation of function of DksA, a new dimension has been added to the phenomenon of stringent response. As the final outcome of actions of (p)ppGpp, DksA, 6S RNA and Rsd is similar, there is a need to analyse these mechanisms in a collective manner. We review the recent trends in understanding the regulation of sigma(70) by (p)ppGpp, DksA, Rsd and 6S RNA and present a case for evolving a unified model of RNAP redistribution during starvation by modulation of sigma(70) activity in E. coli.