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FEMS yeast research2010Sep01Vol.10issue(6)

Schizosaccharomyces cryophilus sp nov、核酵母の新種

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

Schizosaccharomyces属は、現在、3種、すなわちSchizosaccharomyces Pombe、Schizosaccharomyces octosporus、およびSchizosaccharomyces japonicusで構成されています。ここでは、これまで未知の種であるSchizosaccharomyces cryophilusについて説明します。S. octosporusと形態学的に類似していますが、大規模サブユニット(LSU)RRNA遺伝子のD1/D2発散ドメイン、RNase PのRNAサブユニット、内部転写スペーサー要素を含むいくつかの急速に進化する配列の分析により、あらゆるものからの有意な発散が明らかになりました。以前に特徴付けられたSchizosaccharomyces株。Lsu rRNA遺伝子のD1/D2ドメインの系統解析に基づいて、S。octosporusはS. cryophilusの最も近い既知の相対であり、2つの種の配列は25ヌクレオチド置換(> 4%)によって異なります。S. cryophilusゲノムのシーケンスとすべての1:1タンパク質オーソログの系統解析により、この観察結果が確認され、形態学的および生理学的特性とともに、S. chraophilusのS. schizosaccharomyces属内の新しい種としての割り当てをサポートします。新種の型ひずみはnrrl y-48691(t)(= nbrc 106824(t)= cbs 11777(t))です。

Schizosaccharomyces属は、現在、3種、すなわちSchizosaccharomyces Pombe、Schizosaccharomyces octosporus、およびSchizosaccharomyces japonicusで構成されています。ここでは、これまで未知の種であるSchizosaccharomyces cryophilusについて説明します。S. octosporusと形態学的に類似していますが、大規模サブユニット(LSU)RRNA遺伝子のD1/D2発散ドメイン、RNase PのRNAサブユニット、内部転写スペーサー要素を含むいくつかの急速に進化する配列の分析により、あらゆるものからの有意な発散が明らかになりました。以前に特徴付けられたSchizosaccharomyces株。Lsu rRNA遺伝子のD1/D2ドメインの系統解析に基づいて、S。octosporusはS. cryophilusの最も近い既知の相対であり、2つの種の配列は25ヌクレオチド置換(> 4%)によって異なります。S. cryophilusゲノムのシーケンスとすべての1:1タンパク質オーソログの系統解析により、この観察結果が確認され、形態学的および生理学的特性とともに、S. chraophilusのS. schizosaccharomyces属内の新しい種としての割り当てをサポートします。新種の型ひずみはnrrl y-48691(t)(= nbrc 106824(t)= cbs 11777(t))です。

The genus Schizosaccharomyces is presently comprised of three species, namely Schizosaccharomyces pombe, Schizosaccharomyces octosporus and Schizosaccharomyces japonicus. Here, we describe a hitherto unknown species, Schizosaccharomyces cryophilus, named for its preference for growth at lower temperatures than the other fission yeast species. Although morphologically similar to S. octosporus, analysis of several rapidly evolving sequences, including the D1/D2 divergent domain of the large subunit (LSU) rRNA gene, the RNA subunit of RNAse P and the internal transcribed spacer elements, revealed significant divergence from any previously characterized Schizosaccharomyces strain. Based on phylogenetic analysis of the D1/D2 domain of the LSU rRNA gene, S. octosporus is the closest known relative of S. cryophilus, with the sequences of the two species differing by 25 nucleotide substitutions (>4%). Sequencing of the S. cryophilus genome and phylogenetic analysis of all 1 : 1 protein orthologs confirmed this observation, and together with morphological and physiological characterization, supports the assignment of S. cryophilus as a new species within the genus Schizosaccharomyces. The type strain of the new species is NRRL Y-48691(T) (=NBRC 106824(T)=CBS 11777(T)).

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