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ウイルスDNA合成を妨げるヘルペスシンプレックスウイルス(HSV)耐性の分子機構は、これまでにUL23(チミジンキナーゼ[TK])およびUL30(DNAポリメラーゼ)遺伝子内の変異の存在に依存していることが報告されています。遺伝子型抗ウイルス抵抗性アッセイの結果の解釈には、耐性変異と自然株間配列の変動との明確な区別が必要です。この研究の目的は、HSV-1およびHSV-2株におけるUL23 TKおよびUL30 DNAポリメラーゼの自然多型を広範囲に記述することであり、アミノ酸変化は抗ウイルス性に対するHSV耐性に潜在的に関連しています。全長UL23およびUL30遺伝子の配列分析が実行されました。94の薬物感受性臨床分離株(43 HSV-1および51 HSV-2)および3つの実験室株(KOS、GHSV-2、およびMS2)が自然多型について研究され、抗ウイルス性に対する耐性の表現型特性を示す25の臨床分離株が研究されました。薬剤耐性変異について分析されました。我々の結果は、TKとDNAポリメラーゼがHSV株の間で高度に保存されており、HSV-2株の変動性が低いことを示しました。この研究は、HSV-1およびHSV-2分離株の両方のウイルス酵素の自然多型の正確なマップを提供し、それぞれTKおよびDNAポリメラーゼについてこれまでに説明したことのない15および51の多型の同定を提供し、遺伝子型の解釈を促進します。抗ウイルス耐性試験。さらに、25の薬剤耐性HSV分離株の遺伝子型特性評価により、TKに位置し、アシクロビル(ACV)耐性を占める可能性のある8つの新しいアミノ酸変化が明らかになりました。
ウイルスDNA合成を妨げるヘルペスシンプレックスウイルス(HSV)耐性の分子機構は、これまでにUL23(チミジンキナーゼ[TK])およびUL30(DNAポリメラーゼ)遺伝子内の変異の存在に依存していることが報告されています。遺伝子型抗ウイルス抵抗性アッセイの結果の解釈には、耐性変異と自然株間配列の変動との明確な区別が必要です。この研究の目的は、HSV-1およびHSV-2株におけるUL23 TKおよびUL30 DNAポリメラーゼの自然多型を広範囲に記述することであり、アミノ酸変化は抗ウイルス性に対するHSV耐性に潜在的に関連しています。全長UL23およびUL30遺伝子の配列分析が実行されました。94の薬物感受性臨床分離株(43 HSV-1および51 HSV-2)および3つの実験室株(KOS、GHSV-2、およびMS2)が自然多型について研究され、抗ウイルス性に対する耐性の表現型特性を示す25の臨床分離株が研究されました。薬剤耐性変異について分析されました。我々の結果は、TKとDNAポリメラーゼがHSV株の間で高度に保存されており、HSV-2株の変動性が低いことを示しました。この研究は、HSV-1およびHSV-2分離株の両方のウイルス酵素の自然多型の正確なマップを提供し、それぞれTKおよびDNAポリメラーゼについてこれまでに説明したことのない15および51の多型の同定を提供し、遺伝子型の解釈を促進します。抗ウイルス耐性試験。さらに、25の薬剤耐性HSV分離株の遺伝子型特性評価により、TKに位置し、アシクロビル(ACV)耐性を占める可能性のある8つの新しいアミノ酸変化が明らかになりました。
The molecular mechanisms of herpes simplex virus (HSV) resistance to antiviral drugs interfering with viral DNA synthesis reported so far rely on the presence of mutations within UL23 (thymidine kinase [TK]) and UL30 (DNA polymerase) genes. The interpretation of genotypic antiviral resistance assay results requires the clear distinction between resistance mutations and natural interstrain sequence variations. The objectives of this work were to describe extensively the natural polymorphism of UL23 TK and UL30 DNA polymerase among HSV-1 and HSV-2 strains and the amino acid changes potentially associated with HSV resistance to antivirals. The sequence analysis of the full-length UL23 and UL30 genes was performed. Ninety-four drug-sensitive clinical isolates (43 HSV-1 and 51 HSV-2) and 3 laboratory strains (KOS, gHSV-2, and MS2) were studied for natural polymorphism, and 25 clinical isolates exhibiting phenotypic traits of resistance to antivirals were analyzed for drug resistance mutations. Our results showed that TK and DNA polymerase are highly conserved among HSV strains, with a weaker variability for HSV-2 strains. This study provided a precise map of the natural polymorphism of both viral enzymes among HSV-1 and HSV-2 isolates, with the identification of 15 and 51 polymorphisms never previously described for TK and DNA polymerase, respectively, which will facilitate the interpretation of genotypic antiviral-resistant testing. Moreover, the genotypic characterization of 25 drug-resistant HSV isolates revealed 8 new amino acid changes located in TK and potentially accounting for acyclovir (ACV) resistance.
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