バクテリオファージのゲノム分析ϕab1、ϕKMV様ウイルスに感染する多剤耐性アシネトバクターbaumanniiに感染する

多剤耐性アシネトバクターbaumanniiの多くの臨床分離株に感染する可能性のある溶解性バクテリオファージϕab1の完全なゲノム配列を提示します。最近孤立したバクテリオファージは、ポドビリダエ科に似た形態を示しています。ϕAB1ゲノムは、46の可能なオープンリーディングフレーム（ORF）を含む41,526 bpの線形二本鎖DNAです。予測された構造タンパク質の大部分は、質量分析分析によりファージ粒子の一部として同定されました。ビリオンの形態、全体的なゲノム構造、およびRNAポリメラーゼの系統樹によれば、ϕAB1はϕKMV様ファージの新しいメンバーであることを提案します。さらに、推定上のHNHエンドヌクレアーゼをコードする4つのORFを特定しました。そのうちの1つは、遺伝子のDNAポリメラーゼを統合して作成すると推定されます。また、潜在的な溶解カセットが後期ゲノムで特定されました。このバクテリオファージの溶解力は、A。baumanniiの特異性と組み合わされており、ϕab1は治療または消毒の用途にとって魅力的な薬剤になります。

We present the complete genomic sequence of a lytic bacteriophage ϕAB1 which can infect many clinical isolates of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. The recently isolated bacteriophage displays morphology resembling Podoviridae family. The ϕAB1 genome is a linear double-stranded DNA of 41,526 bp containing 46 possible open reading frames (ORFs). The majority of the predicted structural proteins were identified as part of the phage particle by mass spectrometry analysis. According to the virion morphology, overall genomic structure, and the phylogenetic tree of RNA polymerase, we propose that ϕAB1 is a new member of the ϕKMV-like phages. Additionally, we identified four ORFs encoding putative HNH endonucleases, one of which is presumed to integrate and create a genes-in-pieces DNA polymerase. Also, a potential lysis cassette was identified in the late genome. The lytic power of this bacteriophage combined with its specificity for A. baumannii makes ϕAB1 an attractive agent for therapeutic or disinfection applications.