Ruminococcus champanellensis sp nov、ヒト腸内微生物叢からのセルロース分解細菌

18p13（t）と呼ばれる厳密に嫌気性のセルロール溶解株が、ヒトの糞便サンプルから分離されました。細胞はグラム陽性の非運動性コッチでした。株18p13（t）は微結晶セルロースを分解することができましたが、可溶性糖の利用はセロビオースに制限されていました。アセテートとコハク酸塩は、セルロースとセロビオース発酵の主要な最終産物でした。16S rRNA遺伝子配列分析により、分離株はルミノコッカス科のルミノコッカス属に属していることが明らかになりました。最も近い系統系相対は、反ruminal皮膚セルロール分解株Ruminococcus Flavefaciens ATCC 19208（t）（<95％16S rRNA遺伝子配列類似性）でした。株18p13（t）のDNA G+C含有量は53.05±0.7 mol％でした。系統解析と形態学的および生理学的データに基づいて、株18p13（t）は、有効に公開された名前を持つRuminococcus属の他のメンバーと区別できます。Ruminococcus champanellensis sp。11月。18p13（t）（= DSM 18848（t）= JCM 17042（t））が型ひずみとして提案されています。

A strictly anaerobic, cellulolytic strain, designated 18P13(T), was isolated from a human faecal sample. Cells were Gram-positive non-motile cocci. Strain 18P13(T) was able to degrade microcrystalline cellulose but the utilization of soluble sugars was restricted to cellobiose. Acetate and succinate were the major end products of cellulose and cellobiose fermentation. 16S rRNA gene sequence analysis revealed that the isolate belonged to the genus Ruminococcus of the family Ruminococcaceae. The closest phylogenetic relative was the ruminal cellulolytic strain Ruminococcus flavefaciens ATCC 19208(T) (<95% 16S rRNA gene sequence similarity). The DNA G+C content of strain 18P13(T) was 53.05±0.7 mol%. On the basis of phylogenetic analysis, and morphological and physiological data, strain 18P13(T) can be differentiated from other members of the genus Ruminococcus with validly published names. The name Ruminococcus champanellensis sp. nov. is proposed, with 18P13(T) (=DSM 18848(T)=JCM 17042(T)) as the type strain.