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HIV-2グループAは、世界のさまざまな地域、特にアフリカ、ポルトガル、スペイン、フランス、英国、米国、韓国、インドで支配的です。アジア諸国の中で、インドはすべてのHIV-2感染の約95％を占めています。HIV-2の有病率は、マハラシュトラ、ゴア、タミルナードゥ、西ベンガル、ウッタルプラデシュなど、インドのさまざまな州から報告されています。本研究では、インドのHIV-2セロポジティブな個人から分離された10のHIV-2グループAインド株の膜貫通領域（GP36）配列を分析しました。GP36膜貫通領域の1.0 kB領域のHIV BLAST分析では、これらのシーケンスがすべてHIV-2グループAに属していることが示されています。系統発生分析は、CameroonとSenegalのHIV-2グループAシーケンスを持つ配列クラスターが示されたことを示しました。以前に広く中和する決定要因として報告された位置645-656（Yelqklnswdvf）で見つかったエピトープは、10の研究シーケンスすべてで非常によく保存されていました。インドと南アフリカのHIV-2グループA GP36シーケンスの類似性の割合は90％（範囲86-100、SD 2.8）であり、他の非サブタイプAクレードは84％（範囲77-100、SD 6.06）であり、全体の変動性が低いことを示しています。報告されたHIV-2シーケンス。同様に、HIV-1（GP41）およびHIV-2（GP36）のエンベロープ膜貫通領域のコンセンサスアミノ酸配列は非常に同義であり、87％の類似性を示しています。ただし、一般的なHIV 2グループAインド株のGP36膜貫通領域に関する情報は限られています。GP105領域で報告された同義語置換の速度は有意に高く、HIV-2の毒性が低いことを示唆しています。これは進化速度が低くなりますが、GP36膜貫通領域のDN/DS比は1未満であり、そのことを示しています。構造的および機能的制約における保存と重要性（p <0.05）。
HIV-2グループAは、世界のさまざまな地域、特にアフリカ、ポルトガル、スペイン、フランス、英国、米国、韓国、インドで支配的です。アジア諸国の中で、インドはすべてのHIV-2感染の約95％を占めています。HIV-2の有病率は、マハラシュトラ、ゴア、タミルナードゥ、西ベンガル、ウッタルプラデシュなど、インドのさまざまな州から報告されています。本研究では、インドのHIV-2セロポジティブな個人から分離された10のHIV-2グループAインド株の膜貫通領域（GP36）配列を分析しました。GP36膜貫通領域の1.0 kB領域のHIV BLAST分析では、これらのシーケンスがすべてHIV-2グループAに属していることが示されています。系統発生分析は、CameroonとSenegalのHIV-2グループAシーケンスを持つ配列クラスターが示されたことを示しました。以前に広く中和する決定要因として報告された位置645-656（Yelqklnswdvf）で見つかったエピトープは、10の研究シーケンスすべてで非常によく保存されていました。インドと南アフリカのHIV-2グループA GP36シーケンスの類似性の割合は90％（範囲86-100、SD 2.8）であり、他の非サブタイプAクレードは84％（範囲77-100、SD 6.06）であり、全体の変動性が低いことを示しています。報告されたHIV-2シーケンス。同様に、HIV-1（GP41）およびHIV-2（GP36）のエンベロープ膜貫通領域のコンセンサスアミノ酸配列は非常に同義であり、87％の類似性を示しています。ただし、一般的なHIV 2グループAインド株のGP36膜貫通領域に関する情報は限られています。GP105領域で報告された同義語置換の速度は有意に高く、HIV-2の毒性が低いことを示唆しています。これは進化速度が低くなりますが、GP36膜貫通領域のDN/DS比は1未満であり、そのことを示しています。構造的および機能的制約における保存と重要性（p <0.05）。
HIV-2 group A is predominant in different parts of the world, especially Africa, Portugal, Spain, France, the United Kingdom, the United States, Korea, and India. Among the Asian countries, India accounts for about 95% of all HIV-2 infections. The prevalence of HIV-2 has been reported from various states of India such as Maharashtra, Goa, Tamil Nadu, West Bengal, and Uttar Pradesh. In the present study, we analyzed transmembrane region (gp36) sequences of 10 HIV-2 group A Indian strains, isolated from Indian HIV-2-seropositive individuals. HIV Blast analysis for the 1.0-Kb region of the gp36 transmembrane region has shown that all these sequences belong to HIV-2 group A. Phylogenetic analysis indicated that the sequences cluster with HIV-2 group A sequences of Cameroon and Senegal. The epitope found at position 645-656 (YELQKLNSWDVF), previously reported as a broadly neutralizing determinant, was very well conserved in all 10 study sequences. The percentage similarity between Indian and South African HIV-2 group A gp36 sequences was 90% (range 86-100, SD 2.8) and with other nonsubtype A clades was 84% (range 77-100, SD 6.06) indicating overall less variability among the reported HIV-2 sequences. Similarly, the consensus amino acid sequences of the envelope transmembrane region of HIV-1 (gp41) and HIV-2 (gp36) is quite synonymous, indicating 87% similarity; however, limited information is available about the gp36 transmembrane region of the prevalent HIV 2 group A Indian strain. The rate of synonymous substitutions reported in the gp105 region was significantly higher, suggesting lower virulence of HIV-2, which does translate into a lower rate of evolution, while the dN/dS ratio for the gp36 transmembrane region was less than one, indicating its conservation and significance (p<0.05) in structural and functional constraints.
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