cDNAライブラリースクリーニングによって発見されたヒトサイトメガロウイルス臨床株の新規転写産物

ヒトサイトメガロウイルス（HCMV）は、既知のヒトヘルペスウイルスの最大ゲノム（〜235 kb）を備えた二本鎖DNAウイルスです。ほとんどのHCMV予測遺伝子のコーディング電位と転写構造は特定されていません。臨床株には、新しいまたは未知の遺伝子が存在する可能性があります。後期発現相でHCMV臨床株の全長cDNAライブラリーを構築するために、スマート（RNAテンプレートの5 '末端テンプレートのスイッチングメカニズム）技術を使用しました。ランダムに選択されたクローンがシーケンスされました。シーケンスされた発現配列タグを使用して、HCMVのいくつかの予測された予測遺伝子の発現と転写構造を識別しました。以前に検出されたUL99、TRL5/IRL5、UL73からUL75、UL4、およびUL115遺伝子の転写産物は、このライブラリのフルレングス構造で得られました。UL/B '遺伝子のいくつかの転写産物とUL83、UL87、およびUL31の3つのアンチセンス転写産物を含むいくつかの新しい転写産物が見つかりました。発見された新規転写産物、特にUL83、UL87、およびUL31のアンチセンス転写産物は、HCMV遺伝子の転写が以前に予測されたよりも複雑であることを示しました。私たちの研究では、HCMVの新しい遺伝子と転写産物を発見するためのフルレングスcDNAライブラリーの有用性を強調しています。

Human cytomegalovirus (HCMV) is a double-stranded DNA virus with the largest genome (~235 kb) of the known human herpes viruses. The coding potential and transcript structures of most HCMV predicted genes have not been identified. New or unknown genes could exist in clinical strains. The SMART (switching mechanism at 5' end of RNA template of reverse transcriptase) technique was used to construct a full-length cDNA library of an HCMV clinical strain in the late expression phase. Randomly selected clones were sequenced. The sequenced expressed sequence tags were used to identify the expression and transcript structures of some predicted and unpredicted genes of HCMV. The transcripts of the UL99, TRL5/IRL5, UL73 to UL75, UL4, and UL115 genes, which were previously detected, were obtained with full-length structures from this library. Some novel transcripts, including several transcripts of UL/b' genes and three antisense transcripts of UL83, UL87 and UL31 were found. The novel transcripts that were found, particularly the antisense transcripts of UL83, UL87 and UL31, showed that the transcription of HCMV genes is more complex than previously predicted. Our study highlights the usefulness of the full-length cDNA library for discovering new genes and transcripts of HCMV.