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トリプルネガティブ乳がん（TNBC）は、癌の非常に多様なグループであり、分子ベースの治療法をよりよく特定するためにサブタイピングが必要です。この研究では、21の乳がんデータセットから遺伝子発現（GE）プロファイルを分析し、587のTNBC症例を特定しました。クラスター分析では、2つの基底様（BL1およびBL2）、免疫調節（IM）、間葉系（M）、間葉系幹様（MSL）、およびAルミナルアンドロゲン受容体を含む一意のGEおよびオントロジーを表示する6つのTNBCサブタイプを特定しました（lar）サブタイプ。さらに、GE分析により、これらのサブタイプを代表するTNBC細胞株モデルを特定することができました。予測された「ドライバー」シグナル伝達経路は、これらの細胞株モデルでは、異なるGEシグネチャの分析が治療の選択を知らせることができるという概念の証明として、これらの細胞株モデルで薬理学的に標的とされていました。BL1およびBL2サブタイプは、細胞周期およびDNA損傷応答遺伝子の発現が高く、代表的な細胞株がシスプラチンに優先的に応答しました。MおよびMSLサブタイプは、上皮間葉系遷移のためにGEを濃縮し、成長因子経路と細胞モデルはNVP-BEZ235（PI3K/MTOR阻害剤）およびダサチニブ（ABL/SRC阻害剤）に応答しました。LARサブタイプには、再発のない生存率の低下患者が含まれ、アンドロゲン受容体（AR）シグナル伝達によって特徴付けられました。LAR細胞株は、ビカルタミド（AR拮抗薬）に対して独特に敏感でした。これらのデータは、バイオマーカーの選択、創薬、および適切な標的療法にTNBC患者を調整できるようにする臨床試験設計に役立つ可能性があります。
トリプルネガティブ乳がん（TNBC）は、癌の非常に多様なグループであり、分子ベースの治療法をよりよく特定するためにサブタイピングが必要です。この研究では、21の乳がんデータセットから遺伝子発現（GE）プロファイルを分析し、587のTNBC症例を特定しました。クラスター分析では、2つの基底様（BL1およびBL2）、免疫調節（IM）、間葉系（M）、間葉系幹様（MSL）、およびAルミナルアンドロゲン受容体を含む一意のGEおよびオントロジーを表示する6つのTNBCサブタイプを特定しました（lar）サブタイプ。さらに、GE分析により、これらのサブタイプを代表するTNBC細胞株モデルを特定することができました。予測された「ドライバー」シグナル伝達経路は、これらの細胞株モデルでは、異なるGEシグネチャの分析が治療の選択を知らせることができるという概念の証明として、これらの細胞株モデルで薬理学的に標的とされていました。BL1およびBL2サブタイプは、細胞周期およびDNA損傷応答遺伝子の発現が高く、代表的な細胞株がシスプラチンに優先的に応答しました。MおよびMSLサブタイプは、上皮間葉系遷移のためにGEを濃縮し、成長因子経路と細胞モデルはNVP-BEZ235（PI3K/MTOR阻害剤）およびダサチニブ（ABL/SRC阻害剤）に応答しました。LARサブタイプには、再発のない生存率の低下患者が含まれ、アンドロゲン受容体（AR）シグナル伝達によって特徴付けられました。LAR細胞株は、ビカルタミド（AR拮抗薬）に対して独特に敏感でした。これらのデータは、バイオマーカーの選択、創薬、および適切な標的療法にTNBC患者を調整できるようにする臨床試験設計に役立つ可能性があります。
Triple-negative breast cancer (TNBC) is a highly diverse group of cancers, and subtyping is necessary to better identify molecular-based therapies. In this study, we analyzed gene expression (GE) profiles from 21 breast cancer data sets and identified 587 TNBC cases. Cluster analysis identified 6 TNBC subtypes displaying unique GE and ontologies, including 2 basal-like (BL1 and BL2), an immunomodulatory (IM), a mesenchymal (M), a mesenchymal stem-like (MSL), and a luminal androgen receptor (LAR) subtype. Further, GE analysis allowed us to identify TNBC cell line models representative of these subtypes. Predicted "driver" signaling pathways were pharmacologically targeted in these cell line models as proof of concept that analysis of distinct GE signatures can inform therapy selection. BL1 and BL2 subtypes had higher expression of cell cycle and DNA damage response genes, and representative cell lines preferentially responded to cisplatin. M and MSL subtypes were enriched in GE for epithelial-mesenchymal transition, and growth factor pathways and cell models responded to NVP-BEZ235 (a PI3K/mTOR inhibitor) and dasatinib (an abl/src inhibitor). The LAR subtype includes patients with decreased relapse-free survival and was characterized by androgen receptor (AR) signaling. LAR cell lines were uniquely sensitive to bicalutamide (an AR antagonist). These data may be useful in biomarker selection, drug discovery, and clinical trial design that will enable alignment of TNBC patients to appropriate targeted therapies.
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