胎児および新生児病理サンプルの染色体異常を検出するための代替QF-PCRおよびMLPA診断戦略の実装と経験

染色体異常は、妊娠喪失の重要な原因です。固体組織胎児および新生児の病理サンプルは、細胞培養後の核型分析によって日常的に調べられます。ただし、故障率が高く、このアプローチは高価で労働集約的です。したがって、定量的蛍光ポリメラーゼ連鎖反応（QF-PCR）およびサブテロメアマルチプレックスライゲーション依存プローブ増幅（MLPA）分析を含む新しい分子戦略を評価しました。遡及的監査では、異常な症例の4％未満がこの分子戦略によって検出されないことが示されました。この戦略は、胎児の喪失、出生、新生児死亡、妊娠の終了、再発流産、乳児期の突然の予期しない死の症例を含む110の患者サンプルの細胞遺伝学的分析と並行して検証しました。この検証により、両方の戦略に結果をもたらした57のサンプルのうち55が一致していることが示されました。診断テストの1年目に、分子戦略によって382個のサンプルを分析しました。16％の異常率が観察されました。これらには、QF-PCRによって検出された三価13、18、21、モノソミーX、および三倍体が含まれ（77％）、23％はMLPAによって検出された他のトリソミーとサブテロメアの不均衡でした。この戦略は、細胞培養および細胞遺伝学的分析で観察された20％〜30％の故障率とは対照的に、92％の成功率でした。QF-PCRとサブテロメアMLPAは、胎児および新生児の病理サンプルの大部分の分析に適した戦略であり、従来の細胞遺伝学的分析よりも多くの利点があると結論付けています。

Chromosomal abnormalities are a significant cause of pregnancy loss. Solid tissue fetal and neonatal pathology samples are routinely examined by karyotype analysis after cell culture. However, there is a high failure rate, and this approach is expensive and labor intensive. We have therefore evaluated a new molecular strategy involving quantitative fluorescent polymerase chain reaction (QF-PCR) and subtelomere multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) analysis. A retrospective audit showed that less than 4% of abnormal cases may not be detected by this molecular strategy. We validated this strategy in parallel with cytogenetic analysis on 110 patient samples, which included cases of fetal loss, still birth, neonatal death, termination of pregnancy, recurrent miscarriage, and sudden unexpected death in infancy. This validation showed that 55 of the 57 samples that gave a result for both strategies were concordant. During the 1st year of diagnostic testing, we analyzed 382 samples by the molecular strategy. A 16% abnormality rate was observed. These included trisomies 13, 18, 21, monosomy X, and triploidy detected by QF-PCR (77%), and 23% were other trisomies and subtelomere imbalances detected by MLPA. This strategy had a 92% success rate in contrast to the 20%-30% failure rate observed with cell culture and cytogenetic analysis. We conclude that QF-PCR and subtelomere MLPA is a suitable strategy for analysis of the majority of fetal and neonatal pathology samples, with many advantages over conventional cytogenetic analysis.