Ralstonia pickettiiおよびRalstonia insidiosaの遺伝子型および表現型の多様性は

背景：Ralstonia pickettiiは、院内感染剤であり、重要な産業的汚染物質です。臨床状況、土壌、工業用高純度の水など、さまざまな環境で発見されています。この研究では、さまざまなソースから収集されたラルストニアの株の選択の表現型と遺伝子型の多様性を比較しています。 結果：臨床、産業、環境の起源からのラルストニア分離株（59）を、i）種特異的-PCR、ii）16S-23S RRNA間領域（ISR）IIIのPCRおよび配列決定を使用して遺伝子型で比較しました。種の特異的PCRは、59の指定されたR. pickettii分離株のうち15が実際に密接に関連する種R. insidiosaであると特定しました。16S-23S rRNA ISRのPCRリボタイピングは、分離株間にほとんど大きな違いを示しています。すべての分離株の分析により、RAPDプライマーとボックスプライマーの両方のさまざまなバンディングパターンが示されましたが、これらは大きく変化しないことがわかりました。 結論：R。広い地理的および環境源から分離されたPickettii種は、遺伝子型および表現型の特性に基づいて合理的に均質であるように見えます。R. insidiosaは現在、種固有のPCRを使用してR. pickettiiとのみ区別できます。R. pickettiiおよびR. insidiosa分離株は、環境的または地理的起源に基づいて、表現型または遺伝子型に有意に異なるものではありません。

BACKGROUND: Ralstonia pickettii is a nosocomial infectious agent and a significant industrial contaminant. It has been found in many different environments including clinical situations, soil and industrial High Purity Water. This study compares the phenotypic and genotypic diversity of a selection of strains of Ralstonia collected from a variety of sources. RESULTS: Ralstonia isolates (fifty-nine) from clinical, industrial and environmental origins were compared genotypically using i) Species-specific-PCR, ii) PCR and sequencing of the 16S-23S rRNA Interspatial region (ISR) iii) the fliC gene genes, iv) RAPD and BOX-PCR and v) phenotypically using biochemical testing. The species specific-PCR identified fifteen out of fifty-nine designated R. pickettii isolates as actually being the closely related species R. insidiosa. PCR-ribotyping of the 16S-23S rRNA ISR indicated few major differences between the isolates. Analysis of all isolates demonstrated different banding patterns for both the RAPD and BOX primers however these were found not to vary significantly. CONCLUSIONS: R. pickettii species isolated from wide geographic and environmental sources appear to be reasonably homogenous based on genotypic and phenotypic characteristics. R. insidiosa can at present only be distinguished from R. pickettii using species specific PCR. R. pickettii and R. insidiosa isolates do not differ significantly phenotypically or genotypically based on environmental or geographical origin.