ナイーブHIV-1感染患者におけるプロテアーゼ阻害剤レジメンにおけるGAG-POLマイノリティウイルス集団のダイナミクス

目的：最近、抗レトロウイルスネイブ患者におけるデュアルブーストプロテアーゼ阻害剤レジメンのウイルス学的転帰に関するベースラインGAG切断部位の突然変異の役割を報告しました（2IP-ANRS 127試験）。この材料の目的は、2IP-ANRS 127の試験から、ウイルス学的失敗を経験している患者、ベースラインおよびGAG切断部位、GAG-POL FRAMESHIFTおよびProtaess-Coding領域のウイルス障害に存在するウイルスの準種を特徴付けることでした。 方法：4人の患者では、クローン分析により、GAG切断部位のウイルス集団（p17/p24、p24/p2、p2/p7、p7/p1、p1/p6（gag））、p6（gag）、p6（gag）を分析しました。GAG-POL FRAMESHIFT [P1/Transframe Protein（TFP）/P6（POL）]およびプロテアーゼコーディング領域。 結果：プロテアーゼコード領域のクローン分析では、4人の患者すべてで主要なプロテアーゼ阻害剤耐性関連変異を検出できませんでした。1人の患者では、I15Vで混乱したバリアントがベースラインと24週の間で13から100％に増加しました。GAGおよびGAG-POL切断部位のクローン分析により、ベースラインとウイルス学的障害の間のP2/P7切断部位の特定のウイルス集団の増加が示されました。3人の患者。その中で、私たちは1人の患者で、ウイルス障害の主要な集団はP2/P7およびTFP/P6（POL）特異的遺伝子型プロファイルにP6（T）APPモチーフとP6（GAG）とTheの重複に関連していると説明しました。同じ個々の分子クローン上のI15Vプロテアーゼ変異。 結論：ベースラインとウイルス学的障害の間のP2/P7切断部位における少数のウイルス集団の出現を強調しました。さらに、特定のプロテアーゼ変異とGAGおよびGAG-POL切断部位の置換との関連を示し、ウイルス学的転帰における彼らの可能性のある役割を示唆しました。

OBJECTIVE: Recently, we have reported the role of baseline gag cleavage site mutations on the virological outcome of a dual-boosted protease inhibitor regimen in antiretroviral-naive patients (2IP-ANRS 127 trial). The objective of this substudy was to characterize, in patients experiencing virological failure, from the 2IP-ANRS 127 trial, the viral quasispecies present at baseline and at virological failure in gag cleavage site, in gag-pol frameshift and in protease-coding region. METHODS: In four patients, we analysed by clonal analysis the viral population in gag cleavage site (p17/p24, p24/p2, p2/p7, p7/p1, p1/p6(gag)), in p6(gag), in gag-pol frameshift [p1/transframe protein (TFP)/p6(pol)] and in protease-coding region. RESULTS: Clonal analysis of protease-coding region failed to detect major as well as minor protease inhibitor resistance-associated mutations in all four patients. In one patient, a I15V-mutated variant increased from 13 to 100% between baseline and week 24. Clonal analysis of gag and gag-pol cleavage site showed an increase in specific viral populations in p2/p7 cleavage site between baseline and virological failure in three patients. Among them, we described in one patient, that the predominant population at virological failure harboured in p2/p7 and TFP/p6(pol)-specific genotypic profiles associated with duplication of the P(T)APP motif in p6(gag) and the I15V protease mutation on the same individual molecular clones. CONCLUSION: We highlighted the emergence of minority viral populations in the p2/p7 cleavage site between baseline and virological failure. In addition, we showed the association of a specific protease mutation with gag and gag-pol cleavage site substitutions, suggesting their possible role in virological outcome.