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Fa yi xue za zhi2011Aug01Vol.27issue(4)

[一卵性双子の血液サンプルにおけるDNAメチル化プロファイルの違い]

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PMID:21913554DOI:
文献タイプ:
  • English Abstract
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Twin Study
概要
Abstract

目的:一次双子の血液サンプルにおけるDNAメチル化プロファイルの違いを調査することにより、一接合双生児の個々の識別におけるDNAメチル化の潜在的な有用性を評価する。 方法:22組の一接合双生児からの血液サンプルがインフォームドコンセントで得られました。ゲノムDNA抽出物を亜硫酸塩処理した後、インフニウムヒューマチル化27ビードチップアッセイ(イルミナ、米国)で検出しました。一卵性双子の各ペアと同じ性別の無関係な個体の各ペア間のエピジェネティックな距離は、ユークリッド距離アルゴリズムで計算されました。一接合性双子群におけるエピジェネティック距離の分布は、無関係な個人のエピジェネティック距離と比較されました。 結果:男性と女性のペア間のエピジェネティックな距離の違いは、無関係な個々のグループまたは一接合双子群で統計的に有意ではありませんでした(それぞれP = 0.0695および0.4825)。一接合双生児のエピジェネティックな距離は、同じ性別の無関係な個々のペアのエピジェネティック距離よりも有意に低かった(中央値:6.02対7.20、p = 0.0002)。ただし、一卵性双子グループまたは無関係な個人のすべてのエピジェネティックな距離は、4.00よりも有意に高かった(P <0.000 1)。 結論:一卵性双子の血液サンプルのDNAメチル化プロファイルは、互いに著しく異なっていました。これは、同じ性別の無関係な個人と同様でした。これらの結果は、DNAメチル化が一卵性双子の個々の差別において有用なバイオマーカーであることを示しています。

目的:一次双子の血液サンプルにおけるDNAメチル化プロファイルの違いを調査することにより、一接合双生児の個々の識別におけるDNAメチル化の潜在的な有用性を評価する。 方法:22組の一接合双生児からの血液サンプルがインフォームドコンセントで得られました。ゲノムDNA抽出物を亜硫酸塩処理した後、インフニウムヒューマチル化27ビードチップアッセイ(イルミナ、米国)で検出しました。一卵性双子の各ペアと同じ性別の無関係な個体の各ペア間のエピジェネティックな距離は、ユークリッド距離アルゴリズムで計算されました。一接合性双子群におけるエピジェネティック距離の分布は、無関係な個人のエピジェネティック距離と比較されました。 結果:男性と女性のペア間のエピジェネティックな距離の違いは、無関係な個々のグループまたは一接合双子群で統計的に有意ではありませんでした(それぞれP = 0.0695および0.4825)。一接合双生児のエピジェネティックな距離は、同じ性別の無関係な個々のペアのエピジェネティック距離よりも有意に低かった(中央値:6.02対7.20、p = 0.0002)。ただし、一卵性双子グループまたは無関係な個人のすべてのエピジェネティックな距離は、4.00よりも有意に高かった(P <0.000 1)。 結論:一卵性双子の血液サンプルのDNAメチル化プロファイルは、互いに著しく異なっていました。これは、同じ性別の無関係な個人と同様でした。これらの結果は、DNAメチル化が一卵性双子の個々の差別において有用なバイオマーカーであることを示しています。

OBJECTIVE: To evaluate the potential usefulness of DNA methylation in individual discrimination of monozygotic twins by investigating the differences of DNA methylation profiles in monozygotic twins' blood samples. METHODS: Blood samples from 22 pairs of monozygotic twins were obtained with informed consent. Genomic DNA extracts were bisulfite treated followed by detection with Infinium HumanMethylation27 BeadChip Assays(Illumina, USA). Epigenetic distances between each pair of monozygotic twins and each pair of unrelated individuals of same gender were calculated with Euclidean distance algorithms. Distribution of epigenetic distance in monozygotic twin group was statistically compared with that in unrelated individuals. RESULTS: Difference of epigenetic distance between male and female pairs was not statistically significant in unrelated individual group or in monozygotic twin group (P = 0.0695 and 0.4825, respectively). Epigenetic distance of monozygotic twins was significantly lower than that of unrelated individual pair of same gender (Median: 6.02 vs 7.20, P = 0.0002). However, all the epigenetic distance in monozygotic twin group or in unrelated individuals were significantly higher than 4.00 (P < 0.000 1). CONCLUSION: DNA methylation profiles of monozygotic twin's blood samples were significantly different with each other, which was similar to that in unrelated individuals of same gender. These results indicated that DNA methylation was a useful biomarker in individual discrimination of monozygotic twins.

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