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硝化は、多くの生態系の機能に不可欠なグローバルな窒素サイクルの中心的なプロセスです。特に、多くの環境でのアンモニア酸化バクテリア(AOB)に対する数値的支配が明らかになったため、Thaumarchaeota門内での独立栄養アンモニア酸化アルカエア(AOA)の発見は、硝化の微生物学の認識を変えました。これらおよび他のデータは、Thaumarchaeota(AEA)のすべてのAMOAをコードするメンバーが独立栄養窒素症であるという広く保持されている仮定につながりました。この研究では、AEAとAOBの存在について52の市営および産業廃水処理プラントがスクリーニングされました。アモアを運ぶThaumarchaeotaは、4つの産業工場でのみ高い存在量で検出されました。1つの植物では、土壌グループI.1bに密接に関連するThaumarchaeotesは、最大10,000倍のAOBを上回り、この連続培養システムでの積極的な成長によってのみ説明できる数字は、自己栄養アンモニア酸化によって持続するよりも2〜3桁高くなりました。一貫して、(14)Co(2)固定はAOBでのみ検出されますが、微小autoradiographyと組み合わせた魚を介してこの植物からの積極的に硝化スラッジではAEAでは検出されませんでした。さらに、(13)Co(2)の添加後の古細菌のin situ転写、およびクレナルチョールの非常に弱いin situ標識は、アンモニウムの添加とは無関係でした。これらのデータは、一部のAMOA-Carrying Group I.1b Thaumarchaeotaが義務的な化学リトオートトロフィスではないことを示しています。
硝化は、多くの生態系の機能に不可欠なグローバルな窒素サイクルの中心的なプロセスです。特に、多くの環境でのアンモニア酸化バクテリア(AOB)に対する数値的支配が明らかになったため、Thaumarchaeota門内での独立栄養アンモニア酸化アルカエア(AOA)の発見は、硝化の微生物学の認識を変えました。これらおよび他のデータは、Thaumarchaeota(AEA)のすべてのAMOAをコードするメンバーが独立栄養窒素症であるという広く保持されている仮定につながりました。この研究では、AEAとAOBの存在について52の市営および産業廃水処理プラントがスクリーニングされました。アモアを運ぶThaumarchaeotaは、4つの産業工場でのみ高い存在量で検出されました。1つの植物では、土壌グループI.1bに密接に関連するThaumarchaeotesは、最大10,000倍のAOBを上回り、この連続培養システムでの積極的な成長によってのみ説明できる数字は、自己栄養アンモニア酸化によって持続するよりも2〜3桁高くなりました。一貫して、(14)Co(2)固定はAOBでのみ検出されますが、微小autoradiographyと組み合わせた魚を介してこの植物からの積極的に硝化スラッジではAEAでは検出されませんでした。さらに、(13)Co(2)の添加後の古細菌のin situ転写、およびクレナルチョールの非常に弱いin situ標識は、アンモニウムの添加とは無関係でした。これらのデータは、一部のAMOA-Carrying Group I.1b Thaumarchaeotaが義務的な化学リトオートトロフィスではないことを示しています。
Nitrification is a core process in the global nitrogen cycle that is essential for the functioning of many ecosystems. The discovery of autotrophic ammonia-oxidizing archaea (AOA) within the phylum Thaumarchaeota has changed our perception of the microbiology of nitrification, in particular since their numerical dominance over ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in many environments has been revealed. These and other data have led to a widely held assumption that all amoA-encoding members of the Thaumarchaeota (AEA) are autotrophic nitrifiers. In this study, 52 municipal and industrial wastewater treatment plants were screened for the presence of AEA and AOB. Thaumarchaeota carrying amoA were detected in high abundance only in four industrial plants. In one plant, thaumarchaeotes closely related to soil group I.1b outnumbered AOB up to 10,000-fold, and their numbers, which can only be explained by active growth in this continuous culture system, were two to three orders of magnitude higher than could be sustained by autotrophic ammonia oxidation. Consistently, (14)CO(2) fixation could only be detected in AOB but not in AEA in actively nitrifying sludge from this plant via FISH combined with microautoradiography. Furthermore, in situ transcription of archaeal amoA, and very weak in situ labeling of crenarchaeol after addition of (13)CO(2), was independent of the addition of ammonium. These data demonstrate that some amoA-carrying group I.1b Thaumarchaeota are not obligate chemolithoautotrophs.
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