アシネトバクターbaumanniiの臨床分離株におけるペニシリン結合タンパク質をコードする遺伝子の分析

アシネトバクターbaumanniiのβ-ラクタムに対する耐性におけるペニシリン結合タンパク質（PBP）の役割に関する情報は限られています。この研究では、A。baumannii分離株のPBP遺伝子の対立遺伝子変異の分析を示しています。スペインの3つの教育病院からの26のA. baumannii臨床分離株（感受性または耐性）が含まれていました。抗菌薬感受性プロファイル、クローンパターン、およびゲノム種の同定も評価されました。A. baumanniiの6つの完全なゲノムに基づいて、PBP遺伝子が同定され、各遺伝子に対してプライマーが設計されました。遺伝子のヌクレオチド配列は、PBPと対応するアミノ酸配列をATCC 17978のものと比較したことを同定しました。7つのPBP遺伝子と1つの単室トランスグリコシラーゼ（MGT）遺伝子が6つのゲノムで同定され、4つの高等層プロテイン（I）エンコーディング（2つのクラスA）[MRCB]、および2つのクラスB、PBP2 [PBPAまたはMRDA]およびPBP3 [FTSI]）、（II）3つの低分子質量タンパク質（5型、PBP5/6 [DACC]およびPBP6B [DACD]、およびタイプ7）（PBP7/8 [PBPG]）の1つ、III）（MTGA）が観察されましたが、ゲノムのPBP遺伝子に対応するアミノ酸コンセンサス配列のほとんどは、臨床酸に関連していましたPBP6Bをコードする遺伝子を破壊することは、参加者病院の1つの固有のカルバペネム耐性クローンで同定されました。

There is limited information on the role of penicillin-binding proteins (PBPs) in the resistance of Acinetobacter baumannii to β-lactams. This study presents an analysis of the allelic variations of PBP genes in A. baumannii isolates. Twenty-six A. baumannii clinical isolates (susceptible or resistant to carbapenems) from three teaching hospitals in Spain were included. The antimicrobial susceptibility profile, clonal pattern, and genomic species identification were also evaluated. Based on the six complete genomes of A. baumannii, the PBP genes were identified, and primers were designed for each gene. The nucleotide sequences of the genes identified that encode PBPs and the corresponding amino acid sequences were compared with those of ATCC 17978. Seven PBP genes and one monofunctional transglycosylase (MGT) gene were identified in the six genomes, encoding (i) four high-molecular-mass proteins (two of class A, PBP1a [ponA] and PBP1b [mrcB], and two of class B, PBP2 [pbpA or mrdA] and PBP3 [ftsI]), (ii) three low-molecular-mass proteins (two of type 5, PBP5/6 [dacC] and PBP6b [dacD], and one of type 7 (PBP7/8 [pbpG]), and (iii) a monofunctional enzyme (MtgA [mtgA]). Hot spot mutation regions were observed, although most of the allelic changes found translated into silent mutations. The amino acid consensus sequences corresponding to the PBP genes in the genomes and the clinical isolates were highly conserved. The changes found in amino acid sequences were associated with concrete clonal patterns but were not directly related to susceptibility or resistance to β-lactams. An insertion sequence disrupting the gene encoding PBP6b was identified in an endemic carbapenem-resistant clone in one of the participant hospitals.