メキシコ系アメリカ人の大規模なミトコンドリアシーケンスは、ネイティブアメリカンの起源の再評価を示唆しています

背景：ネイティブアメリカンのアジア起源はほとんど受け入れられています。ただし、アジア内のソース集団、創業者グループの発散と到着時間、拡張イベントの数、および新世界への移行ルートに関しては、不確実性が持続します。過去20年間にわたって提示されたMtDNAデータは、ベリンギャンの土地質量が重要な役割を果たす単一移動モデルを提案するために使用されてきました。 結果：568のミトコンドリアゲノムの分析では、2つの異なる変異速度を使用して計算されたネイティブアメリカンとシベリアとアジアの系統の間の共有根の合体年齢推定値はA4（27.5±6.8 KYA/22.7±7.4 KYA）、C1（21.4.4.4.4 Kya）です。±2.7 KYA/16.4±1.5 KYA）、C4（21.0±4.6 KYA/20.0±6.4 KYA）、およびD4E1（24.1±9.0 KYA/17.9±10.0 KYA）。同じ2つの突然変異率（A2：19.5±1.3 KYA/16.1±1.5 KYA、B2：20.8±2.0 KYA/18.1±2.4 KYA、C1：21.4±2.7 KYA/16.4±±±±±±±±±±±2.4±±±±±2.4±±±±±±2.4±±±±2.4±±±±2.4±±±±を使用して計算された汎アメリカのハプログループの合体年齢推定値1.5 KYAおよびD1：17.2±2.0 KYA/14.9±2.2 KYA）およびアメリカ内の人口拡大の推定（〜21-16 KYA）は、クロビス以前の新世界の占領をサポートしています。アメリカのハプロープA2、B2、D1およびC1B、C1CおよびC1Dサブハプログループ内のサブリネージの系統地理学は複雑で、地理的な北、中央、南アメリカに主に特異的です。ただし、一部のサブブランチ（B2B、C1B、C1C、C1D、およびD1F）は、アメリカに拡大する前にアメリカの創設者ハプログループにすでに存在していました。 結論：我々の結果は、ネイティブアメリカンの創設者が最後の氷河最大（LGM）の間にシベリアとアジアの先祖から分岐し、LGMピーク（〜20-16 KYA）の直後にアメリカに拡大したことを示唆しています。ハプログループC1の系統地理学は、このアメリカの創設者ハプログループがシベリアアジアで区別されたことを示唆しています。Haplogroup B2の状況はあまり明確ではありませんが、ハプログループA2とD1は、ネイティブアメリカンの創設者の発散の直後に分化した可能性があります。拡張の直前にアメリカ人の創設者集団における中程度の人口瓶の首は、アメリカで最ももっともらしいものをもたらしました。北米、中央アメリカ、南アメリカにおける多様性指数とベイジアンスカイライン分析の同様の推定値は、これらの地理的地域のほぼ同時（南アメリカから北アメリカまで〜2.0 ky）を示唆しています。汎アメリカのハプログループ。

BACKGROUND: The Asian origin of Native Americans is largely accepted. However uncertainties persist regarding the source population(s) within Asia, the divergence and arrival time(s) of the founder groups, the number of expansion events, and migration routes into the New World. mtDNA data, presented over the past two decades, have been used to suggest a single-migration model for which the Beringian land mass plays an important role. RESULTS: In our analysis of 568 mitochondrial genomes, the coalescent age estimates of shared roots between Native American and Siberian-Asian lineages, calculated using two different mutation rates, are A4 (27.5 ± 6.8 kya/22.7 ± 7.4 kya), C1 (21.4 ± 2.7 kya/16.4 ± 1.5 kya), C4 (21.0 ± 4.6 kya/20.0 ± 6.4 kya), and D4e1 (24.1 ± 9.0 kya/17.9 ± 10.0 kya). The coalescent age estimates of pan-American haplogroups calculated using the same two mutation rates (A2:19.5 ± 1.3 kya/16.1 ± 1.5 kya, B2:20.8 ± 2.0 kya/18.1 ± 2.4 kya, C1:21.4 ± 2.7 kya/16.4 ± 1.5 kya and D1:17.2 ± 2.0 kya/14.9 ± 2.2 kya) and estimates of population expansions within America (~21-16 kya), support the pre-Clovis occupation of the New World. The phylogeography of sublineages within American haplogroups A2, B2, D1 and the C1b, C1c and C1d subhaplogroups of C1 are complex and largely specific to geographical North, Central and South America. However some sub-branches (B2b, C1b, C1c, C1d and D1f) already existed in American founder haplogroups before expansion into the America. CONCLUSIONS: Our results suggest that Native American founders diverged from their Siberian-Asian progenitors sometime during the last glacial maximum (LGM) and expanded into America soon after the LGM peak (~20-16 kya). The phylogeography of haplogroup C1 suggest that this American founder haplogroup differentiated in Siberia-Asia. The situation is less clear for haplogroup B2, however haplogroups A2 and D1 may have differentiated soon after the Native American founders divergence. A moderate population bottle neck in American founder populations just before the expansion most plausibly resulted in few founder types in America. The similar estimates of the diversity indices and Bayesian skyline analysis in North America, Central America and South America suggest almost simultaneous (~ 2.0 ky from South to North America) colonization of these geographical regions with rapid population expansion differentiating into more or less regional branches across the pan-American haplogroups.